9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4087 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4087  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3708  hypothetical protein  49.85 
 
 		 327 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.170262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  23.94 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  25.83 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  30.82 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  23.28 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  25.53 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  24.77 
 
 		 285 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>