27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1825 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  577  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  41.82 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  38.63 
 
 
287 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  39.04 
 
 
300 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  42.77 
 
 
270 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  40.35 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  30.25 
 
 
286 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  32.98 
 
 
302 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  30.63 
 
 
285 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  32.14 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  38.64 
 
 
285 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  29.89 
 
 
282 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  33.51 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  27.89 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  32.43 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  25.44 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  26.16 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  24.47 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  23.24 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  24.91 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  25.95 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  27.31 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  22.58 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  23.66 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  28.08 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  22.49 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  30.43 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>