33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3085 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  46.49 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  38.63 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  42.86 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  40.68 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  41.98 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  30.74 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  32.86 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  34.94 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  33.51 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  34.66 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  24.22 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  26.22 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  25.67 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  30.16 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  27.04 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  30.27 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  26.88 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  29.52 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  23.23 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  26.74 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  24.24 
 
 		 298 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  25.77 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  29.07 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3708  hypothetical protein  22.5 
 
 		 327 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.170262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  27.46 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4087  hypothetical protein  23.6 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  39.29 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  34.38 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  34.38 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  34.38 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>