27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1070 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  587  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  52.38 
 
 		 298 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  50.68 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  44.26 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  32.87 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  33.56 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  31.27 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  30.42 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  31.47 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  28.18 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  28.42 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  27.89 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  26.71 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  25.53 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  27.27 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  25.34 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  27.87 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  35.48 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  25.77 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  30.93 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  23.21 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  24.14 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  29.31 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  29.35 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  29.83 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  27.31 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>