29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1792 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  86.58 
 
 		 298 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  50.68 
 
 		 296 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  46.15 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  31.16 
 
 		 290 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  29.12 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  28.01 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  29.12 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  26.35 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  26.71 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  26.44 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  26.64 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  26.25 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  26.22 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  24.91 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  27.15 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  26.8 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  25.99 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  26.52 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  30.39 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  25.67 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  23.53 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  30.57 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  27.49 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  29.38 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  31.05 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  24.33 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  49.02 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  46 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>