24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0511 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  604  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  31.29 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  26.94 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  28.86 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  30.43 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  27.27 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  30.05 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  27.53 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  23.45 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  25.26 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  32.52 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  25.26 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  26.17 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  27.48 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  25.55 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  27.87 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  28.02 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  26.86 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  22.62 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  22.49 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  30.88 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  24.61 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  34.56 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>