More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2640 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2640  inner-membrane translocator  100 
 
 
356 aa  686    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4377  inner-membrane translocator  45.09 
 
 
355 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2789  inner-membrane translocator  46.15 
 
 
350 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0355549 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  40.99 
 
 
624 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3727  inner-membrane translocator  39.67 
 
 
334 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0972645  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5341  inner-membrane translocator  39.42 
 
 
342 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.442606  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3293  hypothetical protein  38.06 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6103  inner-membrane translocator  37.01 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106487  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1471  inner-membrane translocator  36.01 
 
 
353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0927911  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  37.01 
 
 
357 aa  162  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  34.09 
 
 
356 aa  155  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  35.18 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  34.1 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
358 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  33.01 
 
 
346 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  31.29 
 
 
300 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  36.1 
 
 
347 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1113  branched-chain amino-acid ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2933  inner-membrane translocator  32.44 
 
 
356 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1035  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
350 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.977456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1160  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.63 
 
 
350 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.625358  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0477  inner-membrane translocator  31.63 
 
 
345 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000104814  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 
350 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  30.79 
 
 
299 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32 
 
 
317 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  30.66 
 
 
345 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  33.01 
 
 
297 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.75 
 
 
307 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  30.29 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  28.86 
 
 
324 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.91 
 
 
325 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  30.99 
 
 
326 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  31.53 
 
 
297 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  27.91 
 
 
327 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  30.15 
 
 
606 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 
298 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  28.43 
 
 
326 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  30.12 
 
 
328 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  30.21 
 
 
593 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  30.77 
 
 
407 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  30.36 
 
 
327 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3103  inner-membrane translocator  31.4 
 
 
340 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  28.76 
 
 
463 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  28.2 
 
 
317 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  29.76 
 
 
399 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
328 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
328 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  29.61 
 
 
593 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  27.43 
 
 
357 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  28.32 
 
 
463 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  29.01 
 
 
345 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  28.87 
 
 
398 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  27.34 
 
 
389 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  31.67 
 
 
830 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  27.3 
 
 
317 aa  99.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  29.39 
 
 
318 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  28.15 
 
 
337 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0685  inner-membrane translocator  28.33 
 
 
290 aa  99  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00962366  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1427  inner-membrane translocator  29.47 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.732914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  29.94 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  32.94 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  34.47 
 
 
299 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  27.93 
 
 
571 aa  97.4  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  27.67 
 
 
463 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  29.69 
 
 
589 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  27.98 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.85 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  27.41 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  27.44 
 
 
358 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.74 
 
 
389 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  27.03 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  25.91 
 
 
360 aa  96.3  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  28.21 
 
 
359 aa  96.3  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  25.7 
 
 
331 aa  95.9  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  29.97 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.59 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  27.55 
 
 
389 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.63 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.59 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.59 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2396  inner-membrane translocator  27.46 
 
 
461 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00825655 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.59 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  27.38 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  30.82 
 
 
477 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  27.1 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 
389 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  29.04 
 
 
282 aa  94  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  27.25 
 
 
389 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  27.57 
 
 
389 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  28.38 
 
 
321 aa  92.8  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  27.69 
 
 
590 aa  92.8  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  29.32 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  28.57 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
470 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  27.51 
 
 
389 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  32.26 
 
 
358 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  30.55 
 
 
311 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>