More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0337 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0337  ferredoxin  100 
 
 
323 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.64 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  38.49 
 
 
775 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  37.23 
 
 
330 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1139  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.09 
 
 
334 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  32.5 
 
 
319 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  35.38 
 
 
328 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  36.31 
 
 
784 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1342  ferredoxin  35.53 
 
 
322 aa  159  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  35.9 
 
 
788 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.71 
 
 
317 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  33.01 
 
 
320 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  35.22 
 
 
315 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  36.33 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  34.7 
 
 
321 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3385  oxidoreductase FAD-binding region  34.92 
 
 
329 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00882636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  39.63 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.13 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.57 
 
 
318 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  32.81 
 
 
317 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  33.55 
 
 
316 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  33.55 
 
 
316 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.43 
 
 
783 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  36.66 
 
 
321 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  36.66 
 
 
321 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  35.29 
 
 
782 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  36.42 
 
 
328 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.55 
 
 
322 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  36.66 
 
 
321 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  36.19 
 
 
319 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.99 
 
 
317 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  36.05 
 
 
321 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  32.08 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  36.54 
 
 
794 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  36.08 
 
 
784 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  36.08 
 
 
784 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  36.08 
 
 
784 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  36.08 
 
 
784 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  33.64 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  36.59 
 
 
784 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  36.08 
 
 
784 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  35.16 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  36.28 
 
 
784 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4141  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.91 
 
 
330 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.482707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  35.74 
 
 
318 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.39 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  32.48 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  35.56 
 
 
327 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  32.09 
 
 
319 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  35.55 
 
 
780 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  35.05 
 
 
321 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  33.97 
 
 
317 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  33.75 
 
 
321 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  33.76 
 
 
320 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  36.36 
 
 
316 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  33.23 
 
 
322 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  36.22 
 
 
322 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.44 
 
 
321 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  36.28 
 
 
783 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  35.26 
 
 
309 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  33.44 
 
 
321 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  33.44 
 
 
321 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.44 
 
 
321 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  33.44 
 
 
321 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  33.76 
 
 
788 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.44 
 
 
321 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.63 
 
 
321 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  33.01 
 
 
319 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  32.71 
 
 
320 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.41 
 
 
319 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  34.69 
 
 
324 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  34.05 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7104  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.01 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  30.86 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  32.52 
 
 
558 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  33.85 
 
 
323 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  33.97 
 
 
322 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1367  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.22 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  33.44 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.75 
 
 
321 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  34.26 
 
 
754 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.12 
 
 
321 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  30.46 
 
 
318 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  33.23 
 
 
317 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  31.78 
 
 
316 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  33.33 
 
 
333 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2186  putative oxydoreductase  33.01 
 
 
326 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  31.78 
 
 
316 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  33.33 
 
 
333 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  32.09 
 
 
316 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  36.59 
 
 
769 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26070  vanillate demethylase subunit B  36.82 
 
 
314 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3958  ferredoxin  35.18 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60959  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5381  ferredoxin  35.51 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1906  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.01 
 
 
330 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.44 
 
 
331 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.63 
 
 
316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2586  ferredoxin  32.8 
 
 
314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.645644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.69 
 
 
321 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  32.61 
 
 
774 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>