More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2586 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2586  ferredoxin  100 
 
 		 314 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3208  Pdr/VanB family oxidoreductase  71.88 
 
 		 314 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  43.91 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  41.14 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  39.25 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.34 
 
 		 316 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  40.2 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  40.2 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  38.08 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.46 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  37.34 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  38.39 
 
 		 321 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  39.87 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  39.2 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  38.39 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  38.56 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  39.41 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.5 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  38.82 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  41.35 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  38.08 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  38.82 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  38.08 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  40.31 
 
 		 319 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.03 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  38.41 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  39.88 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.15 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  33.23 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  38.7 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  40.56 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  35.99 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  37.89 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.52 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  37.38 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  38.27 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  38.19 
 
 		 588 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  37.46 
 
 		 316 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  37.12 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  37.46 
 
 		 316 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  35.48 
 
 		 320 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  41.19 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  37.58 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  37.2 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  36.39 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  36.88 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  37.03 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  36.62 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.54 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  38.49 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  37.31 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  38.17 
 
 		 319 aa  188  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  37.34 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.97 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  38.11 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  37.34 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  36.39 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  35.31 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  39.63 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  38.69 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  38.61 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  38.56 
 
 		 783 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  38.8 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  37.93 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  35.83 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  36.11 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  38.11 
 
 		 784 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  38.11 
 
 		 784 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  37.8 
 
 		 784 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  37.8 
 
 		 784 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  37.8 
 
 		 784 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  37.8 
 
 		 784 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  37.8 
 
 		 784 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  36.59 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.49 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  33.65 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  37.41 
 
 		 318 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  35.03 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  34.38 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  35.03 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  37.77 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  36.16 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  32.81 
 
 		 321 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  36.72 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  36.16 
 
 		 775 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.59 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  37.13 
 
 		 657 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  35.86 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  37.29 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  33.44 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  36.96 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  36.96 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  36.96 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  33.44 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.96 
 
 		 783 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  33.86 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  36.88 
 
 		 318 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  36.57 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  36.57 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>