101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5233 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5233  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
1162 aa  2405    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1979  aminopeptidase N-like protein  31.61 
 
 
1179 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881454  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2630  hypothetical protein  29.9 
 
 
1194 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  29.2 
 
 
1185 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  29.28 
 
 
1185 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  29.2 
 
 
1185 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1188  hypothetical protein  29.21 
 
 
1186 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  28.45 
 
 
1185 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1751  hypothetical protein  28.69 
 
 
1185 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0074  hypothetical protein  28.4 
 
 
1216 aa  493  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  28.01 
 
 
1194 aa  449  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4874  hypothetical protein  26.75 
 
 
1215 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.70631  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.23 
 
 
506 aa  72.8  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.91 
 
 
480 aa  71.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.76 
 
 
835 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  21.61 
 
 
489 aa  69.7  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.73 
 
 
482 aa  66.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.04 
 
 
470 aa  64.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.83 
 
 
504 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3210  hypothetical protein  20.12 
 
 
758 aa  62.4  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336034  hitchhiker  0.00714683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  22.22 
 
 
690 aa  62  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.62 
 
 
504 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  22.22 
 
 
681 aa  59.7  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  23.73 
 
 
837 aa  59.7  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.03 
 
 
859 aa  59.7  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.9 
 
 
559 aa  58.5  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.85 
 
 
503 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  22.86 
 
 
688 aa  57.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.32 
 
 
696 aa  57  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.81 
 
 
471 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  22.55 
 
 
875 aa  56.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.71 
 
 
688 aa  56.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  24.57 
 
 
855 aa  56.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.99 
 
 
768 aa  55.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  26.38 
 
 
887 aa  55.1  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.23 
 
 
518 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  29.51 
 
 
846 aa  53.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  23.58 
 
 
851 aa  53.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.11 
 
 
846 aa  53.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1441  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.16 
 
 
661 aa  52.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  23.49 
 
 
446 aa  52.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.7 
 
 
869 aa  52.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  26.19 
 
 
848 aa  52.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.16 
 
 
863 aa  52.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.16 
 
 
845 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.59 
 
 
860 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.46 
 
 
481 aa  52  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.32 
 
 
858 aa  52.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.34 
 
 
865 aa  52  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  25.64 
 
 
823 aa  52  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.6 
 
 
485 aa  51.6  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.58 
 
 
551 aa  51.6  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  23 
 
 
858 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  19.89 
 
 
850 aa  51.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  23.35 
 
 
881 aa  50.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.29 
 
 
785 aa  50.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.89 
 
 
702 aa  50.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.93 
 
 
834 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  21.72 
 
 
853 aa  49.7  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21 
 
 
854 aa  50.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.08 
 
 
573 aa  49.3  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3712  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.67 
 
 
551 aa  49.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.92 
 
 
863 aa  48.9  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.02 
 
 
499 aa  48.9  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.2 
 
 
506 aa  48.5  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  21 
 
 
485 aa  48.5  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.05 
 
 
609 aa  48.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.26 
 
 
823 aa  47.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  22.42 
 
 
848 aa  48.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  23.22 
 
 
853 aa  48.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  19.16 
 
 
922 aa  47.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.88 
 
 
492 aa  47.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  25 
 
 
853 aa  48.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.57 
 
 
516 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.56 
 
 
488 aa  48.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.14 
 
 
551 aa  47.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  24.42 
 
 
879 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1734  aminopeptidase N  22.82 
 
 
871 aa  47.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.357602  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.12 
 
 
835 aa  47  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  22.18 
 
 
848 aa  46.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  22.94 
 
 
882 aa  46.2  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.49 
 
 
866 aa  46.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.93 
 
 
473 aa  45.8  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  24.58 
 
 
829 aa  46.2  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  20.31 
 
 
877 aa  45.8  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  18.8 
 
 
857 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  20.83 
 
 
852 aa  45.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.82 
 
 
492 aa  45.8  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  18.8 
 
 
857 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.4 
 
 
905 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.47 
 
 
913 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  20.79 
 
 
865 aa  45.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.42 
 
 
878 aa  45.4  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  26.75 
 
 
889 aa  45.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.81 
 
 
824 aa  45.4  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.5 
 
 
492 aa  45.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  23.51 
 
 
849 aa  45.1  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  22.3 
 
 
877 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.06 
 
 
852 aa  45.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.2 
 
 
858 aa  45.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>