52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1028 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1751  hypothetical protein  37.51 
 
 
1185 aa  841    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4874  hypothetical protein  34.01 
 
 
1215 aa  698    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.70631  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  37.88 
 
 
1185 aa  863    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  100 
 
 
1194 aa  2438    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0074  hypothetical protein  40.83 
 
 
1216 aa  871    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  37.96 
 
 
1185 aa  864    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  37.71 
 
 
1185 aa  857    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  37.54 
 
 
1185 aa  859    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1188  hypothetical protein  38.73 
 
 
1186 aa  811    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2630  hypothetical protein  40.18 
 
 
1194 aa  894    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5233  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.68 
 
 
1162 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1979  aminopeptidase N-like protein  26.81 
 
 
1179 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.55 
 
 
480 aa  79  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  25.71 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  35.04 
 
 
504 aa  68.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.68 
 
 
506 aa  66.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  29.27 
 
 
690 aa  66.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.5 
 
 
504 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.68 
 
 
834 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.81 
 
 
688 aa  62.4  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.92 
 
 
696 aa  62  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  23.93 
 
 
688 aa  62  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3210  hypothetical protein  23.28 
 
 
758 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336034  hitchhiker  0.00714683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.92 
 
 
828 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.34 
 
 
860 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  22.36 
 
 
489 aa  56.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.62 
 
 
649 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.78 
 
 
865 aa  55.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.19 
 
 
482 aa  55.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15070  aminopeptidase N  22.11 
 
 
438 aa  54.3  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0867784  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.94 
 
 
683 aa  53.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.38 
 
 
686 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.2 
 
 
957 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.62 
 
 
858 aa  50.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.05 
 
 
866 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.37 
 
 
485 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.42 
 
 
689 aa  50.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1169  hypothetical protein  27.67 
 
 
277 aa  50.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1086  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.02 
 
 
552 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827108  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  22.71 
 
 
829 aa  49.3  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  23.71 
 
 
922 aa  48.9  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.27 
 
 
573 aa  48.9  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.64 
 
 
499 aa  48.5  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.32 
 
 
857 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.32 
 
 
857 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  27.87 
 
 
827 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.02 
 
 
518 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.65 
 
 
559 aa  47.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1566  hypothetical protein  27.05 
 
 
439 aa  47.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.8 
 
 
852 aa  45.8  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.27 
 
 
846 aa  46.2  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.03 
 
 
551 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>