49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1751 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1751  hypothetical protein  100 
 
 		 1185 aa  2442    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  88.61 
 
 		 1185 aa  2210    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  89.37 
 
 		 1185 aa  2221    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1188  hypothetical protein  64.92 
 
 		 1186 aa  1650    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  89.54 
 
 		 1185 aa  2222    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2630  hypothetical protein  38.67 
 
 		 1194 aa  867    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0074  hypothetical protein  36.71 
 
 		 1216 aa  784    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  37.51 
 
 		 1194 aa  795    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  89.79 
 
 		 1185 aa  2227    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4874  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1215 aa  585  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.70631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5233  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.69 
 
 		 1162 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1979  aminopeptidase N-like protein  28.17 
 
 		 1179 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.67 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.66 
 
 		 504 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.28 
 
 		 506 aa  66.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.98 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3210  hypothetical protein  23.83 
 
 		 758 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336034  hitchhiker  0.00714683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.89 
 
 		 688 aa  57.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  22.79 
 
 		 688 aa  57  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.22 
 
 		 835 aa  57  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.9 
 
 		 686 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.54 
 
 		 823 aa  56.6  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.13 
 
 		 846 aa  55.1  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.26 
 
 		 551 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.15 
 
 		 860 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.55 
 
 		 696 aa  52.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.4 
 
 		 485 aa  52.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.67 
 
 		 683 aa  52  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  25.14 
 
 		 922 aa  51.6  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  23.23 
 
 		 681 aa  51.6  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.84 
 
 		 828 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  28.69 
 
 		 827 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  23.79 
 
 		 690 aa  50.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.2 
 
 		 649 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.83 
 
 		 866 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.1 
 
 		 822 aa  50.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.56 
 
 		 559 aa  49.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.76 
 
 		 821 aa  49.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.49 
 
 		 824 aa  49.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.36 
 
 		 499 aa  48.9  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.81 
 
 		 689 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.66 
 
 		 858 aa  47.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.06 
 
 		 854 aa  46.6  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.28 
 
 		 822 aa  46.6  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  25.52 
 
 		 545 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  21.26 
 
 		 489 aa  45.8  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.36 
 
 		 957 aa  45.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.6 
 
 		 702 aa  45.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.48 
 
 		 518 aa  44.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>