More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0251 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  77.78 
 
 
504 aa  776    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
504 aa  1007    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  44.47 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.74 
 
 
480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  25.95 
 
 
489 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.97 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.34 
 
 
559 aa  139  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.22 
 
 
482 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.85 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.56 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.54 
 
 
619 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.25 
 
 
517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.64 
 
 
673 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  23.44 
 
 
603 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.99 
 
 
857 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.99 
 
 
857 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.66 
 
 
640 aa  97.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  23.12 
 
 
1079 aa  96.7  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  22 
 
 
628 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  25.58 
 
 
1103 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  21.27 
 
 
922 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.81 
 
 
649 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  28.47 
 
 
690 aa  94  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.51 
 
 
551 aa  94  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  29.37 
 
 
681 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.87 
 
 
456 aa  91.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  23.6 
 
 
1026 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.68 
 
 
536 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  19.32 
 
 
526 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.34 
 
 
485 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.7 
 
 
866 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  27.42 
 
 
480 aa  87.4  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  22.35 
 
 
778 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.43 
 
 
702 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.7 
 
 
620 aa  84.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.48 
 
 
573 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  21.31 
 
 
775 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.24 
 
 
457 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.567205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.7 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  24.04 
 
 
655 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
473 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  23 
 
 
792 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  23.86 
 
 
655 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  23.86 
 
 
655 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  23.86 
 
 
655 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2965  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.1 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.31 
 
 
460 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  25.17 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.09 
 
 
609 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.29 
 
 
834 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.28 
 
 
860 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.63 
 
 
865 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  27.27 
 
 
877 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.06 
 
 
688 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  23.64 
 
 
1185 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  25.72 
 
 
643 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  23.06 
 
 
792 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  23.41 
 
 
1185 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  23.81 
 
 
1185 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3111  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.57 
 
 
633 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.75 
 
 
869 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.15 
 
 
689 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.3 
 
 
516 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  23.46 
 
 
1185 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.8 
 
 
865 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2445  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.57 
 
 
617 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191901  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.57 
 
 
538 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  26.34 
 
 
877 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1188  hypothetical protein  26.79 
 
 
1186 aa  77  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1703  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.83 
 
 
717 aa  76.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.023595  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  32.05 
 
 
647 aa  77  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  23.18 
 
 
801 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  32.05 
 
 
671 aa  76.6  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  23.43 
 
 
663 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  22.39 
 
 
838 aa  76.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  26.36 
 
 
918 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  26.36 
 
 
877 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  26.36 
 
 
877 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  26.36 
 
 
877 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.89 
 
 
506 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.78 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2765  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.54 
 
 
593 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.78 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.8 
 
 
683 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  31.07 
 
 
670 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.43 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  25.91 
 
 
877 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  25.91 
 
 
877 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.15 
 
 
858 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.78 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  25.91 
 
 
877 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  25 
 
 
889 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.19 
 
 
597 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.5 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  22.18 
 
 
668 aa  73.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13602  predicted protein  29.21 
 
 
620 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0213622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.33 
 
 
696 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1386  peptidase M28  30.61 
 
 
736 aa  73.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000135431  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2977  Leukotriene A4 hydrolase  26.05 
 
 
623 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  normal  0.0102393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.67 
 
 
527 aa  73.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>