More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4500 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
473 aa  942    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  37.01 
 
 
488 aa  309  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  36.14 
 
 
470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.62 
 
 
471 aa  220  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.55 
 
 
499 aa  216  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  34.01 
 
 
485 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.98 
 
 
485 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.91 
 
 
527 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.38 
 
 
481 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  32.96 
 
 
446 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.19 
 
 
492 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  32.82 
 
 
509 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  31.12 
 
 
480 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.62 
 
 
506 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.09 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.12 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  30.47 
 
 
429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.29 
 
 
503 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.15 
 
 
536 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.57 
 
 
456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.31 
 
 
673 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.07 
 
 
486 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30 
 
 
442 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.45 
 
 
442 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.45 
 
 
442 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.07 
 
 
538 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.67 
 
 
452 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.59 
 
 
551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.35 
 
 
455 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.1 
 
 
460 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.49 
 
 
448 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.51 
 
 
516 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.24 
 
 
458 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.08 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1698  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.79 
 
 
403 aa  143  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0606871  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.71 
 
 
517 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.89 
 
 
905 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.79 
 
 
858 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.29 
 
 
609 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.5 
 
 
865 aa  130  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.55 
 
 
687 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.01 
 
 
768 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.96 
 
 
834 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  28.41 
 
 
446 aa  124  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.24 
 
 
573 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.07 
 
 
823 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15070  aminopeptidase N  28.88 
 
 
438 aa  121  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0867784  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  23.23 
 
 
545 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.19 
 
 
863 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.17 
 
 
866 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.22 
 
 
857 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.22 
 
 
857 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.59 
 
 
957 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.61 
 
 
860 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.8 
 
 
846 aa  113  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.38 
 
 
822 aa  113  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.37 
 
 
551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.22 
 
 
865 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3712  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.15 
 
 
551 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2867  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.35 
 
 
551 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.930408  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  23.27 
 
 
829 aa  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  26 
 
 
906 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4900  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.97 
 
 
558 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02435  peptidase M1 family protein  22.68 
 
 
582 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.872294  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.58 
 
 
835 aa  101  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4450  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.73 
 
 
547 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.443873  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.79 
 
 
845 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  22.95 
 
 
827 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1086  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.38 
 
 
552 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827108  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4040  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.92 
 
 
546 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0316878 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  24.89 
 
 
870 aa  98.2  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  27.64 
 
 
688 aa  97.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.1 
 
 
854 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.7 
 
 
823 aa  94  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  27.73 
 
 
848 aa  93.6  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  27.16 
 
 
848 aa  93.6  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  27.13 
 
 
862 aa  93.2  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  26.21 
 
 
853 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  25.83 
 
 
681 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  25.99 
 
 
647 aa  92.8  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  27.78 
 
 
846 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  28.48 
 
 
861 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.13 
 
 
824 aa  90.5  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  25.31 
 
 
671 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  26.69 
 
 
867 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  26.69 
 
 
867 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  25.62 
 
 
853 aa  88.6  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  27.55 
 
 
842 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  25.45 
 
 
889 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  26.39 
 
 
867 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  26.97 
 
 
856 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.53 
 
 
822 aa  88.2  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.06 
 
 
686 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3592  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.74 
 
 
648 aa  87.4  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  26.46 
 
 
852 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  27.79 
 
 
855 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.92 
 
 
877 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3459  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.33 
 
 
642 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6491  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.52 
 
 
929 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  28.26 
 
 
823 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>