257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1761 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  88.87 
 
 
689 aa  1232    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
683 aa  1384    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  52.35 
 
 
688 aa  710    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  48.34 
 
 
681 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  48.94 
 
 
690 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  40.22 
 
 
696 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  31.8 
 
 
1103 aa  319  9e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1386  peptidase M28  33.87 
 
 
736 aa  304  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000135431  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.85 
 
 
702 aa  282  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1703  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.03 
 
 
717 aa  223  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.023595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1084  Aminopeptidase N-like protein  31.4 
 
 
658 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1441  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.09 
 
 
661 aa  186  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
834 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.46 
 
 
551 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.48 
 
 
863 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.15 
 
 
865 aa  101  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.74 
 
 
957 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.88 
 
 
499 aa  95.5  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.36 
 
 
828 aa  94.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.82 
 
 
609 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.21 
 
 
673 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.31 
 
 
517 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.88 
 
 
573 aa  90.5  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  24.86 
 
 
446 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.28 
 
 
823 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.9 
 
 
865 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  28.06 
 
 
485 aa  88.2  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.01 
 
 
857 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.68 
 
 
470 aa  85.5  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.01 
 
 
857 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2536  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.03 
 
 
698 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.11 
 
 
821 aa  84.7  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.03 
 
 
480 aa  84  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.82 
 
 
485 aa  84  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.42 
 
 
493 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.61 
 
 
860 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.78 
 
 
506 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.18 
 
 
822 aa  81.6  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.79 
 
 
858 aa  80.9  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.67 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  27.17 
 
 
846 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.94 
 
 
845 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.68 
 
 
824 aa  79  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.71 
 
 
866 aa  78.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.34 
 
 
823 aa  78.6  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.25 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2867  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.62 
 
 
551 aa  77.4  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.930408  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  26.38 
 
 
869 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.38 
 
 
559 aa  76.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.1 
 
 
473 aa  76.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.45 
 
 
822 aa  76.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.65 
 
 
905 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.48 
 
 
538 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  25.64 
 
 
889 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  28.01 
 
 
857 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.8 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  26.28 
 
 
688 aa  75.1  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.33 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.71 
 
 
768 aa  75.1  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.99 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.52 
 
 
518 aa  73.9  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  27 
 
 
509 aa  73.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  26.45 
 
 
883 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  25.35 
 
 
855 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  23.53 
 
 
545 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.29 
 
 
442 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.99 
 
 
551 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.4 
 
 
492 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  23.14 
 
 
870 aa  72.8  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.04 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.44 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  25.81 
 
 
848 aa  72.4  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3712  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.45 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.44 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.57 
 
 
503 aa  72  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  28.32 
 
 
882 aa  70.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.52 
 
 
687 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  23.53 
 
 
856 aa  69.7  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.89 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  24.39 
 
 
867 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  25.89 
 
 
877 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  25.89 
 
 
877 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.37 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  25.22 
 
 
875 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.1 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.07 
 
 
835 aa  67.8  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  24.39 
 
 
867 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  24.39 
 
 
867 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  23.58 
 
 
853 aa  67.4  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.79 
 
 
506 aa  67.4  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  26.32 
 
 
851 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  25.53 
 
 
844 aa  66.6  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.46 
 
 
492 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.03 
 
 
878 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.53 
 
 
460 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  25.24 
 
 
877 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  25.57 
 
 
877 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.44 
 
 
869 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  25.24 
 
 
877 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  25.24 
 
 
918 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>