More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4965 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  44.99 
 
 
850 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  47.29 
 
 
846 aa  641    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  46.2 
 
 
851 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0968  aminopeptidase N  62.67 
 
 
878 aa  957    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  55.78 
 
 
837 aa  848    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  47.93 
 
 
838 aa  692    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  46.01 
 
 
848 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  46.24 
 
 
855 aa  685    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  100 
 
 
857 aa  1692    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  44.06 
 
 
855 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  46.32 
 
 
861 aa  634  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  44.22 
 
 
851 aa  621  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  45.91 
 
 
862 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  44.74 
 
 
854 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  42.99 
 
 
848 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  44.46 
 
 
848 aa  608  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  43.07 
 
 
842 aa  597  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  42.96 
 
 
849 aa  595  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  43.34 
 
 
853 aa  590  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  43.25 
 
 
858 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  43.94 
 
 
850 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  42.33 
 
 
862 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2138  aminopeptidase N  42.76 
 
 
834 aa  588  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  44.84 
 
 
823 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  42.87 
 
 
856 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  42.76 
 
 
863 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  43.64 
 
 
853 aa  578  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  41.71 
 
 
858 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  0.0000185174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  43.73 
 
 
865 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  43.17 
 
 
852 aa  575  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  42.45 
 
 
860 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  43.81 
 
 
868 aa  572  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  43.22 
 
 
889 aa  572  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  43.23 
 
 
862 aa  568  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  38.65 
 
 
871 aa  568  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  44.25 
 
 
849 aa  567  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  41.94 
 
 
867 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  41.84 
 
 
861 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  41.94 
 
 
867 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  41.94 
 
 
867 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  41.68 
 
 
869 aa  558  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  41.83 
 
 
853 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2129  aminopeptidase G  39.95 
 
 
876 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133552  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  37.16 
 
 
869 aa  523  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  39.82 
 
 
874 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  41.45 
 
 
853 aa  507  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  40.85 
 
 
887 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24070  aminopeptidase N  38.13 
 
 
892 aa  493  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  40.59 
 
 
882 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  40.07 
 
 
868 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  40.68 
 
 
882 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  39.76 
 
 
807 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  32.91 
 
 
848 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  32.14 
 
 
853 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  31.95 
 
 
853 aa  405  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  32.48 
 
 
877 aa  392  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  32.25 
 
 
877 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  33.33 
 
 
875 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  31.37 
 
 
918 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  31.37 
 
 
877 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  31.8 
 
 
877 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  31.8 
 
 
877 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  31.55 
 
 
889 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  31.37 
 
 
877 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  33.03 
 
 
877 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  31.01 
 
 
877 aa  376  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  29.97 
 
 
887 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  30.95 
 
 
906 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  31.04 
 
 
879 aa  365  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.38 
 
 
878 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  37.43 
 
 
852 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.79 
 
 
859 aa  200  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.67 
 
 
859 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.29 
 
 
857 aa  199  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.38 
 
 
882 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.64 
 
 
853 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  34.8 
 
 
859 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.51 
 
 
835 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.54 
 
 
869 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.63 
 
 
877 aa  190  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  31.35 
 
 
905 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35 
 
 
913 aa  185  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.47 
 
 
858 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.72 
 
 
830 aa  181  4.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  33.04 
 
 
881 aa  180  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  33.23 
 
 
883 aa  177  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.94 
 
 
882 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  31.21 
 
 
844 aa  175  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.08 
 
 
932 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.66 
 
 
886 aa  174  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.15 
 
 
932 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.06 
 
 
778 aa  172  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.55 
 
 
933 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.14 
 
 
863 aa  171  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.42 
 
 
785 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.52 
 
 
854 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  29.16 
 
 
890 aa  167  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  32.75 
 
 
895 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  26.83 
 
 
870 aa  167  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  30.73 
 
 
875 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>