More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1636 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  55.33 
 
 
690 aa  713    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  52.99 
 
 
689 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  55.67 
 
 
681 aa  738    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  52.87 
 
 
683 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
688 aa  1393    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  42.57 
 
 
696 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1386  peptidase M28  32.65 
 
 
736 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000135431  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  32.8 
 
 
1103 aa  308  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.75 
 
 
702 aa  280  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1703  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  35.61 
 
 
717 aa  219  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.023595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1084  Aminopeptidase N-like protein  32.14 
 
 
658 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1441  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.41 
 
 
661 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.48 
 
 
480 aa  111  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.63 
 
 
863 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.54 
 
 
499 aa  107  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.43 
 
 
865 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2536  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.01 
 
 
698 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.93 
 
 
860 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.06 
 
 
493 aa  97.8  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.43 
 
 
857 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.43 
 
 
857 aa  97.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.46 
 
 
834 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.64 
 
 
551 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.93 
 
 
866 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.26 
 
 
673 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.36 
 
 
573 aa  94  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.96 
 
 
517 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.08 
 
 
957 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.09 
 
 
828 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.49 
 
 
471 aa  91.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.08 
 
 
865 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.56 
 
 
905 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.08 
 
 
485 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.06 
 
 
470 aa  87.8  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  25.22 
 
 
688 aa  87.4  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.58 
 
 
823 aa  86.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.45 
 
 
858 aa  87  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  25.81 
 
 
485 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.06 
 
 
492 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.6 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  27.59 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.22 
 
 
845 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.31 
 
 
768 aa  84.3  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.94 
 
 
823 aa  84.3  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.34 
 
 
518 aa  84  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.87 
 
 
492 aa  84  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.89 
 
 
442 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.4 
 
 
442 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.4 
 
 
442 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.42 
 
 
448 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.12 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  23.68 
 
 
446 aa  82  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.03 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.57 
 
 
687 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.35 
 
 
481 aa  81.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.81 
 
 
538 aa  81.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.4 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.16 
 
 
516 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.32 
 
 
609 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.06 
 
 
504 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.76 
 
 
536 aa  79  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.4 
 
 
527 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.32 
 
 
821 aa  78.6  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.27 
 
 
835 aa  77.4  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.34 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  25.27 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2867  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.62 
 
 
551 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.930408  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.14 
 
 
559 aa  74.3  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  24.85 
 
 
545 aa  73.9  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.77 
 
 
822 aa  73.9  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.69 
 
 
503 aa  73.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  21.99 
 
 
827 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.71 
 
 
506 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.72 
 
 
506 aa  73.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.26 
 
 
877 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.89 
 
 
785 aa  71.2  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.33 
 
 
822 aa  71.2  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  21.28 
 
 
829 aa  70.9  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02435  peptidase M1 family protein  21.39 
 
 
582 aa  70.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.872294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  21.7 
 
 
922 aa  70.5  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  26.16 
 
 
849 aa  70.1  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3210  hypothetical protein  23.41 
 
 
758 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336034  hitchhiker  0.00714683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.29 
 
 
824 aa  70.1  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  26.32 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  25.75 
 
 
846 aa  69.7  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.32 
 
 
455 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.32 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  26.64 
 
 
844 aa  68.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  26.07 
 
 
844 aa  67.8  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  25.91 
 
 
851 aa  67.4  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  24.38 
 
 
875 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0542  aminopeptidase N  28.57 
 
 
878 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.644765  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0476  aminopeptidase N  28.57 
 
 
878 aa  67  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.59204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.11 
 
 
551 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  25.4 
 
 
883 aa  66.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0513  aminopeptidase N  28.46 
 
 
878 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  22.57 
 
 
906 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  28.25 
 
 
857 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0504  lysyl aminopeptidase  26.64 
 
 
844 aa  65.1  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.777579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.46 
 
 
488 aa  64.7  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>