More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0899 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
573 aa  1165    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.7 
 
 
609 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1086  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.32 
 
 
552 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827108  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.26 
 
 
551 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4450  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.4 
 
 
547 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.443873  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02435  peptidase M1 family protein  30.78 
 
 
582 aa  271  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.872294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2867  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.8 
 
 
551 aa  270  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.930408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4040  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.31 
 
 
546 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0316878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  29.59 
 
 
545 aa  264  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3712  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.5 
 
 
551 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.93 
 
 
673 aa  233  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.19 
 
 
957 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4900  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.19 
 
 
558 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.24 
 
 
687 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.82 
 
 
460 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.13 
 
 
499 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  29.7 
 
 
446 aa  153  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.07 
 
 
456 aa  150  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.28 
 
 
517 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.43 
 
 
527 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.26 
 
 
516 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.43 
 
 
538 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.11 
 
 
442 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.11 
 
 
442 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.11 
 
 
442 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.55 
 
 
551 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  28 
 
 
485 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.41 
 
 
458 aa  144  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.82 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.7 
 
 
471 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.88 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.94 
 
 
846 aa  140  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.77 
 
 
493 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.63 
 
 
485 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.93 
 
 
905 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  30.3 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.47 
 
 
768 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.51 
 
 
503 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.94 
 
 
823 aa  134  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.71 
 
 
442 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  29.17 
 
 
429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.69 
 
 
455 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.24 
 
 
473 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.4 
 
 
860 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.99 
 
 
492 aa  123  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  26.4 
 
 
509 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.77 
 
 
835 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.16 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.48 
 
 
824 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.39 
 
 
865 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.65 
 
 
821 aa  121  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.22 
 
 
822 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.74 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.79 
 
 
834 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  26.55 
 
 
446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.61 
 
 
863 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.72 
 
 
492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.86 
 
 
858 aa  116  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.2 
 
 
866 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.71 
 
 
865 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.45 
 
 
857 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.2 
 
 
452 aa  113  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.75 
 
 
857 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  24.71 
 
 
829 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.3 
 
 
506 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15070  aminopeptidase N  25.31 
 
 
438 aa  108  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0867784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.3 
 
 
845 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.48 
 
 
822 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.98 
 
 
823 aa  105  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.05 
 
 
488 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  29.22 
 
 
688 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1698  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.53 
 
 
403 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0606871  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.97 
 
 
486 aa  101  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  24.59 
 
 
827 aa  99.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.52 
 
 
480 aa  94.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.32 
 
 
696 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.36 
 
 
688 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  27.97 
 
 
690 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  28.4 
 
 
681 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3459  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.96 
 
 
642 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  26.41 
 
 
670 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.92 
 
 
683 aa  90.9  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.3 
 
 
689 aa  90.9  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.82 
 
 
933 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  24.63 
 
 
647 aa  88.6  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  26.06 
 
 
850 aa  88.2  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  25.92 
 
 
671 aa  88.2  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  28.06 
 
 
858 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.68 
 
 
859 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.48 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  24.34 
 
 
890 aa  84  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  24.84 
 
 
856 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  26.99 
 
 
860 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  25.95 
 
 
862 aa  82  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.23 
 
 
932 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1551  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.64 
 
 
615 aa  80.9  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.043081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.34 
 
 
686 aa  80.9  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.58 
 
 
828 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2536  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.29 
 
 
698 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  27.93 
 
 
867 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>