81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1441 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1441  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
661 aa  1318    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.35 
 
 
702 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1084  Aminopeptidase N-like protein  33.6 
 
 
658 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1703  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  35.51 
 
 
717 aa  203  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.023595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.94 
 
 
696 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.09 
 
 
683 aa  187  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.08 
 
 
688 aa  187  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  30.02 
 
 
681 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.23 
 
 
689 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1386  peptidase M28  28.14 
 
 
736 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000135431  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  25.34 
 
 
1103 aa  174  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  29.29 
 
 
690 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.26 
 
 
824 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.21 
 
 
823 aa  80.9  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.4 
 
 
821 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.57 
 
 
609 aa  71.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.82 
 
 
822 aa  67.8  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  24.48 
 
 
446 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.2 
 
 
932 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.16 
 
 
846 aa  60.5  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.47 
 
 
932 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.86 
 
 
933 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.48 
 
 
504 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.27 
 
 
516 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0324  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.29 
 
 
874 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5233  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.16 
 
 
1162 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.33 
 
 
470 aa  53.9  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  23.87 
 
 
480 aa  53.5  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.7 
 
 
768 aa  52.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2613  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.76 
 
 
722 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351663  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.62 
 
 
835 aa  52.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.53 
 
 
506 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.31 
 
 
573 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0347  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.69 
 
 
878 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.707127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  23.97 
 
 
875 aa  50.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0424  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.45 
 
 
722 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.39 
 
 
863 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  22.65 
 
 
643 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.99 
 
 
859 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.4 
 
 
504 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.45 
 
 
722 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.476849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0397  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.66 
 
 
722 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.67 
 
 
471 aa  49.3  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.05 
 
 
673 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0466  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.45 
 
 
722 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.470213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0335  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.76 
 
 
878 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  21.88 
 
 
1185 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  21.88 
 
 
877 aa  47.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  21.58 
 
 
1185 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.23 
 
 
853 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.65 
 
 
857 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  21.58 
 
 
1185 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.7 
 
 
492 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2903  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.16 
 
 
723 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.83 
 
 
559 aa  46.6  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  21.32 
 
 
671 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.6 
 
 
859 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  20.86 
 
 
489 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  26.41 
 
 
850 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.15 
 
 
905 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2818  M1 family peptidase  23.13 
 
 
721 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.316749  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1982  aminopeptidase N  25.15 
 
 
851 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3161  M1 family peptidase  23.13 
 
 
721 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3637  M1 family peptidase  23.13 
 
 
721 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3613  M1 family peptidase  23.13 
 
 
721 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0754  aminopeptidase N  23.95 
 
 
867 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1727  M1 family peptidase  23.13 
 
 
721 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357596  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0040  M1 family peptidase  23.13 
 
 
721 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1698  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.86 
 
 
403 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0606871  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  20.76 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3622  peptidase  23.25 
 
 
746 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178496  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.18 
 
 
828 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0692  aminopeptidase N  25.07 
 
 
882 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625099  normal  0.73925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2536  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.94 
 
 
698 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  20.64 
 
 
688 aa  45.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  20.36 
 
 
1194 aa  44.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2945  M1 family peptidase  23.88 
 
 
740 aa  44.3  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.31 
 
 
480 aa  44.3  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.12 
 
 
551 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.64 
 
 
517 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  23.47 
 
 
429 aa  43.9  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>