62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1560 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1751  hypothetical protein  89.37 
 
 
1185 aa  2221    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  100 
 
 
1185 aa  2440    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1188  hypothetical protein  65.09 
 
 
1186 aa  1665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  95.78 
 
 
1185 aa  2363    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2630  hypothetical protein  39.57 
 
 
1194 aa  891    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  98.82 
 
 
1185 aa  2422    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0074  hypothetical protein  36.54 
 
 
1216 aa  785    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  37.29 
 
 
1194 aa  808    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  99.49 
 
 
1185 aa  2434    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4874  hypothetical protein  32.76 
 
 
1215 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.70631  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1979  aminopeptidase N-like protein  28.89 
 
 
1179 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5233  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.2 
 
 
1162 aa  505  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.49 
 
 
480 aa  88.6  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.42 
 
 
506 aa  79.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.46 
 
 
504 aa  77.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.71 
 
 
504 aa  71.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3210  hypothetical protein  22.29 
 
 
758 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336034  hitchhiker  0.00714683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.16 
 
 
846 aa  64.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.77 
 
 
686 aa  62.4  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24 
 
 
688 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.72 
 
 
823 aa  59.7  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.38 
 
 
835 aa  60.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.39 
 
 
485 aa  58.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  23.13 
 
 
688 aa  58.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  22.69 
 
 
922 aa  55.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.55 
 
 
696 aa  55.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.36 
 
 
470 aa  52.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  23.53 
 
 
681 aa  51.6  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.23 
 
 
683 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.49 
 
 
551 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  22.57 
 
 
690 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.33 
 
 
854 aa  50.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.48 
 
 
828 aa  50.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.94 
 
 
499 aa  50.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.43 
 
 
702 aa  49.7  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.3 
 
 
821 aa  50.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  21.54 
 
 
446 aa  50.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.84 
 
 
824 aa  50.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.97 
 
 
559 aa  49.3  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.57 
 
 
866 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.61 
 
 
822 aa  48.9  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  22.48 
 
 
545 aa  48.9  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.6 
 
 
471 aa  48.5  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  21.29 
 
 
865 aa  48.5  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  23.9 
 
 
844 aa  48.5  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.38 
 
 
834 aa  48.5  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  25.4 
 
 
844 aa  48.5  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.53 
 
 
609 aa  47.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.54 
 
 
649 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.56 
 
 
689 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  23.13 
 
 
846 aa  47.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  20.59 
 
 
631 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.41 
 
 
858 aa  47  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.31 
 
 
860 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.39 
 
 
518 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.14 
 
 
957 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  27.05 
 
 
875 aa  46.2  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  22.12 
 
 
489 aa  46.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1441  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.58 
 
 
661 aa  46.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.98 
 
 
863 aa  45.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.21 
 
 
573 aa  45.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24 
 
 
517 aa  44.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>