51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4874 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  34.36 
 
 
1194 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  33.01 
 
 
1185 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4874  hypothetical protein  100 
 
 
1215 aa  2496    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.70631  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  32.76 
 
 
1185 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  32.68 
 
 
1185 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2630  hypothetical protein  33.66 
 
 
1194 aa  635  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  32.6 
 
 
1185 aa  632  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1188  hypothetical protein  31.7 
 
 
1186 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1751  hypothetical protein  32.06 
 
 
1185 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0074  hypothetical protein  31.69 
 
 
1216 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5233  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.74 
 
 
1162 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1979  aminopeptidase N-like protein  25.59 
 
 
1179 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.43 
 
 
828 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3210  hypothetical protein  23.27 
 
 
758 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336034  hitchhiker  0.00714683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.27 
 
 
845 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.02 
 
 
696 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  23.04 
 
 
489 aa  58.9  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.68 
 
 
499 aa  57.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.15 
 
 
559 aa  57  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.96 
 
 
480 aa  57  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.66 
 
 
649 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.42 
 
 
822 aa  56.2  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.47 
 
 
866 aa  55.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.47 
 
 
506 aa  53.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  21.97 
 
 
862 aa  53.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.53 
 
 
858 aa  52.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  21.57 
 
 
829 aa  52  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  22.86 
 
 
681 aa  51.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.2 
 
 
877 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  25.76 
 
 
842 aa  50.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  24.71 
 
 
865 aa  49.3  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1566  hypothetical protein  26.47 
 
 
439 aa  49.3  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  22.33 
 
 
690 aa  49.3  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  25.37 
 
 
823 aa  49.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.71 
 
 
865 aa  48.9  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.61 
 
 
504 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.27 
 
 
504 aa  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  21.88 
 
 
850 aa  47.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.82 
 
 
683 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  23.88 
 
 
688 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.45 
 
 
835 aa  47  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.5 
 
 
686 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.53 
 
 
485 aa  47.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.09 
 
 
957 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.43 
 
 
860 aa  45.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3156  Membrane alanyl aminopeptidase  25.55 
 
 
743 aa  45.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315095  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.57 
 
 
846 aa  45.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.33 
 
 
852 aa  45.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2808  aminopeptidase N  20.6 
 
 
872 aa  45.1  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5329  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.77 
 
 
727 aa  45.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  21.98 
 
 
827 aa  44.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>