More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0348 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  63.85 
 
 
690 aa  844    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  100 
 
 
681 aa  1355    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  55.82 
 
 
688 aa  754    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  48.19 
 
 
683 aa  628  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  46.37 
 
 
689 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  39.94 
 
 
696 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  31.51 
 
 
1103 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1386  peptidase M28  32.3 
 
 
736 aa  324  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000135431  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.78 
 
 
702 aa  272  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1084  Aminopeptidase N-like protein  31.68 
 
 
658 aa  227  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1441  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.02 
 
 
661 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.92 
 
 
551 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.95 
 
 
499 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.27 
 
 
485 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.82 
 
 
834 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.29 
 
 
863 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.71 
 
 
517 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.69 
 
 
481 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.78 
 
 
470 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.48 
 
 
480 aa  101  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.72 
 
 
452 aa  100  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  25.53 
 
 
485 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.6 
 
 
823 aa  97.8  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.8 
 
 
493 aa  96.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  28.71 
 
 
688 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.94 
 
 
865 aa  94.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  26.56 
 
 
446 aa  95.1  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.12 
 
 
518 aa  94.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.08 
 
 
828 aa  94  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.64 
 
 
673 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.39 
 
 
845 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.83 
 
 
473 aa  93.6  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.4 
 
 
573 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2536  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.86 
 
 
698 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.06 
 
 
471 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.37 
 
 
504 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.74 
 
 
527 aa  91.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.97 
 
 
442 aa  91.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.83 
 
 
823 aa  91.3  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.97 
 
 
442 aa  91.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.37 
 
 
905 aa  91.3  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.74 
 
 
442 aa  91.3  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  28.81 
 
 
480 aa  90.9  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.02 
 
 
858 aa  89.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.1 
 
 
492 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.74 
 
 
455 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.93 
 
 
957 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.18 
 
 
857 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.89 
 
 
516 aa  88.6  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.18 
 
 
857 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.28 
 
 
492 aa  87.4  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.93 
 
 
865 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.25 
 
 
442 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.24 
 
 
448 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.94 
 
 
458 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.74 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.28 
 
 
486 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.77 
 
 
609 aa  82.4  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  25.44 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.23 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.46 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.89 
 
 
504 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.02 
 
 
824 aa  80.5  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.2 
 
 
768 aa  80.5  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.93 
 
 
822 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.16 
 
 
866 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.13 
 
 
860 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.76 
 
 
821 aa  78.6  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  25.71 
 
 
1194 aa  79  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  26.61 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  24.07 
 
 
829 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.93 
 
 
551 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.81 
 
 
456 aa  77  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2867  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.38 
 
 
551 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.930408  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.6 
 
 
835 aa  75.5  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.38 
 
 
538 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.9 
 
 
822 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.59 
 
 
559 aa  73.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.13 
 
 
506 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  22.27 
 
 
643 aa  72.4  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  23.78 
 
 
870 aa  72  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  24.28 
 
 
883 aa  71.6  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  25.48 
 
 
857 aa  70.5  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.06 
 
 
835 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.09 
 
 
597 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.37 
 
 
536 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1997  M1 family peptidase  22.44 
 
 
628 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  28.31 
 
 
846 aa  68.6  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.1 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0324  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.72 
 
 
874 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  22.13 
 
 
545 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2965  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.45 
 
 
597 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  26.05 
 
 
844 aa  66.2  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  24.93 
 
 
807 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0542  aminopeptidase N  31.14 
 
 
878 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.644765  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  21.45 
 
 
877 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  21.45 
 
 
877 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  21.34 
 
 
877 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  24.76 
 
 
861 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  24.7 
 
 
856 aa  65.1  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>