More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3232 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
486 aa  988    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  41 
 
 
485 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.18 
 
 
503 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.87 
 
 
481 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  39.52 
 
 
485 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  39.52 
 
 
493 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  39.84 
 
 
499 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  42.54 
 
 
471 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  40.18 
 
 
509 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  42.27 
 
 
538 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  40.27 
 
 
470 aa  270  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  38.04 
 
 
527 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  36.55 
 
 
480 aa  250  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.62 
 
 
506 aa  249  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.82 
 
 
492 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.43 
 
 
492 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.11 
 
 
536 aa  223  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  35.62 
 
 
446 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.43 
 
 
456 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.75 
 
 
458 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.93 
 
 
442 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.93 
 
 
442 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.93 
 
 
442 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.04 
 
 
448 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.86 
 
 
442 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.13 
 
 
455 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.75 
 
 
488 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.71 
 
 
460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.99 
 
 
473 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.68 
 
 
452 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.64 
 
 
516 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  31.19 
 
 
429 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.38 
 
 
517 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.01 
 
 
673 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.71 
 
 
551 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15070  aminopeptidase N  30.12 
 
 
438 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0867784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.88 
 
 
845 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1698  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.21 
 
 
403 aa  127  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0606871  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.49 
 
 
822 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  28.67 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.66 
 
 
768 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.64 
 
 
860 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.61 
 
 
834 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.06 
 
 
865 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.18 
 
 
857 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.42 
 
 
857 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.52 
 
 
866 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.96 
 
 
863 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.83 
 
 
865 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.75 
 
 
905 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.57 
 
 
858 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  24.93 
 
 
829 aa  103  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.11 
 
 
687 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.49 
 
 
823 aa  100  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.97 
 
 
573 aa  100  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  27.16 
 
 
827 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.37 
 
 
859 aa  98.2  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.58 
 
 
551 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.81 
 
 
609 aa  97.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1086  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.96 
 
 
552 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827108  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.3 
 
 
835 aa  93.6  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.6 
 
 
686 aa  93.6  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.38 
 
 
846 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0341  lysyl aminopeptidase  27.64 
 
 
846 aa  92.8  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2818  M1 family peptidase  25.72 
 
 
721 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.316749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3622  peptidase  25.72 
 
 
746 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3161  M1 family peptidase  25.72 
 
 
721 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3637  M1 family peptidase  25.72 
 
 
721 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  25.3 
 
 
688 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3613  M1 family peptidase  25.72 
 
 
721 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0040  M1 family peptidase  25.72 
 
 
721 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1727  M1 family peptidase  25.72 
 
 
721 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357596  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02435  peptidase M1 family protein  22.47 
 
 
582 aa  90.9  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.872294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.04 
 
 
957 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2945  M1 family peptidase  26.07 
 
 
740 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.8 
 
 
822 aa  89  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  22.49 
 
 
870 aa  88.2  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2867  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.98 
 
 
551 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.930408  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.94 
 
 
823 aa  87  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  25.61 
 
 
849 aa  85.1  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  25.39 
 
 
681 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.81 
 
 
824 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  24.6 
 
 
877 aa  84  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4450  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.41 
 
 
547 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.443873  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0424  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.93 
 
 
722 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2613  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.71 
 
 
722 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0397  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.93 
 
 
722 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244204  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.5 
 
 
821 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0466  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.93 
 
 
722 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.470213 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.71 
 
 
722 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.476849  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2903  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.65 
 
 
723 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.83 
 
 
778 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  25.06 
 
 
844 aa  80.9  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  26.47 
 
 
881 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  26 
 
 
862 aa  80.5  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5329  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.01 
 
 
727 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3712  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.13 
 
 
551 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  24.32 
 
 
846 aa  79.7  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.49 
 
 
784 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.8 
 
 
863 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>