More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3425 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
834 aa  1725    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  39.61 
 
 
845 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  38.35 
 
 
863 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  39.31 
 
 
822 aa  472  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  39.03 
 
 
827 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  37.68 
 
 
829 aa  445  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.01 
 
 
858 aa  326  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.56 
 
 
866 aa  321  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.09 
 
 
865 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.86 
 
 
824 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.2 
 
 
823 aa  306  7e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.76 
 
 
905 aa  305  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.06 
 
 
860 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.16 
 
 
865 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.62 
 
 
821 aa  297  5e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.63 
 
 
857 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.63 
 
 
857 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.74 
 
 
822 aa  291  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.41 
 
 
846 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.15 
 
 
835 aa  259  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.5 
 
 
823 aa  257  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.42 
 
 
768 aa  208  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.77 
 
 
673 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.45 
 
 
551 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.86 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  29.19 
 
 
688 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  31.04 
 
 
861 aa  162  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.46 
 
 
503 aa  160  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.74 
 
 
686 aa  158  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  26.17 
 
 
855 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  28.4 
 
 
852 aa  157  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.11 
 
 
458 aa  156  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.56 
 
 
517 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.41 
 
 
471 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  28.61 
 
 
853 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.87 
 
 
470 aa  151  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  26.47 
 
 
854 aa  151  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.94 
 
 
852 aa  150  8e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  26.12 
 
 
446 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  29.06 
 
 
867 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.83 
 
 
442 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  29.06 
 
 
867 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.88 
 
 
442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  29.06 
 
 
867 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.88 
 
 
442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  27.16 
 
 
485 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  29.23 
 
 
846 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  27.88 
 
 
848 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.93 
 
 
506 aa  147  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  24.89 
 
 
855 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  30.42 
 
 
862 aa  146  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  27.6 
 
 
869 aa  146  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.77 
 
 
442 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.51 
 
 
687 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.77 
 
 
830 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  30.66 
 
 
889 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.32 
 
 
878 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  29.61 
 
 
851 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  27.06 
 
 
446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  27.19 
 
 
868 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.47 
 
 
527 aa  142  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.96 
 
 
877 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  27.73 
 
 
882 aa  140  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  29.02 
 
 
887 aa  140  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  28.86 
 
 
877 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4680  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.16 
 
 
738 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.16 
 
 
738 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.604033  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  28.5 
 
 
860 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  27.46 
 
 
861 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  25.55 
 
 
890 aa  139  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.43 
 
 
460 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  28.61 
 
 
858 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  0.0000185174 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  28.11 
 
 
918 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.99 
 
 
853 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  28.11 
 
 
877 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  28.1 
 
 
856 aa  137  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  27.46 
 
 
906 aa  137  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  28.11 
 
 
877 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.56 
 
 
448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  28.11 
 
 
877 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.62 
 
 
456 aa  137  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31787  alanine/arginine aminopeptidase  23.63 
 
 
870 aa  137  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.38 
 
 
859 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3676  aminopeptidase N  24.75 
 
 
868 aa  137  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  27.62 
 
 
857 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  30.26 
 
 
849 aa  137  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  29.06 
 
 
862 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  26.54 
 
 
895 aa  136  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1723  aminopeptidase N  22.51 
 
 
852 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  28.53 
 
 
877 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2662  aminopeptidase N  25.9 
 
 
883 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  28.53 
 
 
877 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  28.9 
 
 
862 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.07 
 
 
455 aa  135  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  24.24 
 
 
850 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  28.32 
 
 
882 aa  135  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.03 
 
 
485 aa  134  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  26.05 
 
 
881 aa  134  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3712  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.08 
 
 
551 aa  134  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.53 
 
 
452 aa  134  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>