More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3603 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5329  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  49.34 
 
 		 727 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00411  putative aminopeptidase transmembrane protein  70.9 
 
 		 748 aa  1101    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2818  M1 family peptidase  49.49 
 
 		 721 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.316749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3622  peptidase  49.49 
 
 		 746 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3161  M1 family peptidase  49.49 
 
 		 721 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 		 738 aa  1526    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.604033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3637  M1 family peptidase  49.49 
 
 		 721 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3613  M1 family peptidase  49.49 
 
 		 721 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4680  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 		 738 aa  1526    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3156  Membrane alanyl aminopeptidase  52.1 
 
 		 743 aa  711    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0040  M1 family peptidase  49.49 
 
 		 721 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1727  M1 family peptidase  49.49 
 
 		 721 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2945  M1 family peptidase  49.62 
 
 		 740 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2903  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  46.34 
 
 		 723 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0397  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  46.51 
 
 		 722 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0466  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  49.6 
 
 		 722 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0424  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  46.37 
 
 		 722 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  49.76 
 
 		 722 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.476849  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2613  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  49.6 
 
 		 722 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3582  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  46.31 
 
 		 722 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.564307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02632  aminopeptidase N  34.55 
 
 		 890 aa  305  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.76 
 
 		 886 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.54 
 
 		 882 aa  277  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0443  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.1 
 
 		 888 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.089278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.33 
 
 		 877 aa  247  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.96 
 
 		 830 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  30 
 
 		 895 aa  229  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  29.52 
 
 		 890 aa  227  6e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.53 
 
 		 859 aa  225  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  28.67 
 
 		 870 aa  220  6e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.25 
 
 		 863 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.89 
 
 		 857 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.7 
 
 		 852 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  28.08 
 
 		 905 aa  212  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.09 
 
 		 859 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  28.39 
 
 		 881 aa  210  9e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.1 
 
 		 853 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.14 
 
 		 859 aa  207  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.7 
 
 		 784 aa  204  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  27 
 
 		 883 aa  203  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.33 
 
 		 778 aa  199  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.77 
 
 		 932 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.68 
 
 		 785 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.59 
 
 		 933 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.32 
 
 		 932 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.61 
 
 		 913 aa  194  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04910  leucyl aminopeptidase, putative  28.01 
 
 		 1018 aa  185  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  28.36 
 
 		 875 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  27.18 
 
 		 846 aa  177  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  28.76 
 
 		 844 aa  176  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0341  lysyl aminopeptidase  29.88 
 
 		 846 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  32.16 
 
 		 856 aa  173  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  28.95 
 
 		 844 aa  170  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31787  alanine/arginine aminopeptidase  24.96 
 
 		 870 aa  167  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6491  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.5 
 
 		 929 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1883  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  31.8 
 
 		 843 aa  164  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  28.96 
 
 		 862 aa  164  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0504  lysyl aminopeptidase  28.54 
 
 		 844 aa  164  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.777579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  32.21 
 
 		 869 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  27.29 
 
 		 853 aa  161  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  25.23 
 
 		 906 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  30.88 
 
 		 851 aa  160  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0324  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.54 
 
 		 874 aa  160  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  32.49 
 
 		 889 aa  160  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  30.62 
 
 		 861 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  30.65 
 
 		 867 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  30.65 
 
 		 867 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  28.1 
 
 		 861 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  30.38 
 
 		 867 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  27.33 
 
 		 849 aa  155  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0335  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.77 
 
 		 878 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  28.06 
 
 		 848 aa  154  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  28.31 
 
 		 848 aa  154  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  26.07 
 
 		 877 aa  154  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0347  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.3 
 
 		 878 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.707127  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  30.05 
 
 		 882 aa  150  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  25.35 
 
 		 850 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  27.07 
 
 		 875 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  27.53 
 
 		 854 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  29.19 
 
 		 862 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  28.53 
 
 		 877 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  30.45 
 
 		 850 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  28.53 
 
 		 918 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  28.53 
 
 		 877 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  28.53 
 
 		 877 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  29.67 
 
 		 852 aa  147  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  29.09 
 
 		 862 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.84 
 
 		 878 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  29.79 
 
 		 887 aa  145  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  26.19 
 
 		 849 aa  144  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  26.55 
 
 		 858 aa  144  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.67 
 
 		 869 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  26.76 
 
 		 855 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  27.78 
 
 		 877 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2358  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.67 
 
 		 855 aa  142  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.249972  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43257  predicted protein  23.56 
 
 		 948 aa  141  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.393184  normal  0.929698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  26.72 
 
 		 855 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.29 
 
 		 854 aa  141  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.64 
 
 		 835 aa  140  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  26.15 
 
 		 846 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>