More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3244 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  68.08 
 
 		 877 aa  1273    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  68.31 
 
 		 877 aa  1276    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  43.76 
 
 		 906 aa  707    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  68.42 
 
 		 918 aa  1281    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  62.51 
 
 		 879 aa  1147    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  67.05 
 
 		 877 aa  1254    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  70.09 
 
 		 878 aa  1325    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  68.54 
 
 		 877 aa  1283    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  68.19 
 
 		 877 aa  1279    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  68.31 
 
 		 877 aa  1277    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  59.77 
 
 		 889 aa  1092    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  100 
 
 		 887 aa  1851    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  68.65 
 
 		 877 aa  1281    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  58.63 
 
 		 875 aa  1077    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  68.42 
 
 		 877 aa  1279    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0962  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.01 
 
 		 871 aa  562  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  35.47 
 
 		 882 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  34.27 
 
 		 850 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  34.42 
 
 		 848 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  34.45 
 
 		 861 aa  469  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  37.73 
 
 		 853 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  34.71 
 
 		 855 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  34.58 
 
 		 849 aa  466  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  35.49 
 
 		 846 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  37.62 
 
 		 862 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  35.76 
 
 		 855 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  35.99 
 
 		 850 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  33.55 
 
 		 848 aa  449  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  33.33 
 
 		 851 aa  446  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  32.6 
 
 		 858 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  0.0000185174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  34.13 
 
 		 852 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  31.87 
 
 		 853 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  38.03 
 
 		 865 aa  442  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  34.5 
 
 		 853 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  32.64 
 
 		 860 aa  439  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  35.34 
 
 		 889 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  35.22 
 
 		 853 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  34.87 
 
 		 853 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2129  aminopeptidase G  34.82 
 
 		 876 aa  436  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133552  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  34.89 
 
 		 871 aa  430  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  33.49 
 
 		 862 aa  432  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  35.29 
 
 		 856 aa  432  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  33.45 
 
 		 869 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  30.83 
 
 		 848 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  34.97 
 
 		 854 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  37.46 
 
 		 868 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  30.96 
 
 		 853 aa  426  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  37.36 
 
 		 868 aa  425  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  32.49 
 
 		 861 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  34.16 
 
 		 849 aa  422  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  34.47 
 
 		 858 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  32.61 
 
 		 867 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  34.18 
 
 		 863 aa  415  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  32.61 
 
 		 867 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  32.49 
 
 		 867 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  32.25 
 
 		 887 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  34.97 
 
 		 869 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  34.7 
 
 		 862 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  32.43 
 
 		 848 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  33.42 
 
 		 851 aa  402  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  35.13 
 
 		 874 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  32.81 
 
 		 882 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  33.38 
 
 		 837 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  30.67 
 
 		 842 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24070  aminopeptidase N  32.24 
 
 		 892 aa  366  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  33.48 
 
 		 882 aa  359  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  33.65 
 
 		 838 aa  340  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  35.49 
 
 		 857 aa  334  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0968  aminopeptidase N  30.15 
 
 		 878 aa  317  6e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2138  aminopeptidase N  28.13 
 
 		 834 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  30.3 
 
 		 823 aa  290  7e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  28.41 
 
 		 807 aa  271  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.73 
 
 		 835 aa  244  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.05 
 
 		 858 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.2 
 
 		 854 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.18 
 
 		 830 aa  232  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.47 
 
 		 852 aa  228  5.0000000000000005e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.93 
 
 		 869 aa  224  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.12 
 
 		 785 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.01 
 
 		 778 aa  219  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.41 
 
 		 857 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  34.13 
 
 		 881 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.48 
 
 		 859 aa  214  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.22 
 
 		 853 aa  214  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  29.98 
 
 		 870 aa  213  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.97 
 
 		 859 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.53 
 
 		 784 aa  207  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  31.05 
 
 		 883 aa  206  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.29 
 
 		 859 aa  205  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.81 
 
 		 882 aa  203  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.5 
 
 		 877 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  25.94 
 
 		 905 aa  191  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  31.23 
 
 		 890 aa  190  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.03 
 
 		 913 aa  184  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.41 
 
 		 886 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  30.13 
 
 		 849 aa  179  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  29.68 
 
 		 846 aa  177  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  28.96 
 
 		 875 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  30.38 
 
 		 895 aa  176  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31787  alanine/arginine aminopeptidase  30.42 
 
 		 870 aa  174  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>