More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1136 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  60.77 
 
 
865 aa  1082    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
865 aa  1778    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  59.7 
 
 
858 aa  1095    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  58.39 
 
 
866 aa  1067    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  58.98 
 
 
857 aa  1061    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  58.98 
 
 
857 aa  1061    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  61.37 
 
 
860 aa  1109    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.25 
 
 
905 aa  589  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.49 
 
 
846 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.95 
 
 
835 aa  451  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  34 
 
 
823 aa  451  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  35.37 
 
 
823 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.53 
 
 
824 aa  437  1e-121  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.65 
 
 
822 aa  433  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.06 
 
 
821 aa  434  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.26 
 
 
845 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.67 
 
 
768 aa  327  4.0000000000000003e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  28.38 
 
 
829 aa  321  3.9999999999999996e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.88 
 
 
863 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.12 
 
 
822 aa  311  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  29.28 
 
 
827 aa  307  6e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.38 
 
 
834 aa  304  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.04 
 
 
551 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.41 
 
 
673 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.04 
 
 
877 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.54 
 
 
442 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.74 
 
 
442 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.74 
 
 
442 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.61 
 
 
517 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  28.26 
 
 
688 aa  168  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.7 
 
 
686 aa  167  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.89 
 
 
458 aa  167  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.66 
 
 
460 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.7 
 
 
499 aa  163  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  27.17 
 
 
855 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  28.31 
 
 
850 aa  155  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  29.21 
 
 
881 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1741  aminopeptidase N  29.06 
 
 
901 aa  154  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00168597  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0445  aminopeptidase N  28.63 
 
 
878 aa  153  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0906  aminopeptidase N  26.95 
 
 
881 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.68 
 
 
859 aa  151  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.09 
 
 
456 aa  150  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  28.64 
 
 
855 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.25 
 
 
452 aa  150  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  23.76 
 
 
889 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.81 
 
 
784 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.19 
 
 
778 aa  149  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  28.15 
 
 
889 aa  149  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  27.1 
 
 
848 aa  149  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.03 
 
 
442 aa  148  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0513  aminopeptidase N  25.61 
 
 
878 aa  147  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093489 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.74 
 
 
785 aa  147  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.33 
 
 
852 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1374  aminopeptidase N  26.77 
 
 
892 aa  147  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  26.82 
 
 
883 aa  146  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  25.22 
 
 
853 aa  147  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  26.53 
 
 
882 aa  147  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  26.37 
 
 
446 aa  147  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0930  aminopeptidase N  24.1 
 
 
882 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.182731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.72 
 
 
448 aa  147  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1079  aminopeptidase N  24.87 
 
 
882 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189522  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  26.56 
 
 
877 aa  145  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2227  aminopeptidase N  25.56 
 
 
853 aa  145  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.396627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  28.89 
 
 
848 aa  145  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0714  aminopeptidase N  27.63 
 
 
882 aa  145  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  26.32 
 
 
877 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  27.74 
 
 
852 aa  144  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  25.11 
 
 
879 aa  144  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4749  aminopeptidase N  25.32 
 
 
876 aa  144  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  25.05 
 
 
877 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  25.24 
 
 
877 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.77 
 
 
830 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  25.05 
 
 
918 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  25.16 
 
 
446 aa  143  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  23.7 
 
 
906 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  25.05 
 
 
877 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.06 
 
 
455 aa  143  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  26.53 
 
 
848 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  30.93 
 
 
862 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.53 
 
 
882 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  30.03 
 
 
853 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  27.81 
 
 
856 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.83 
 
 
886 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  26.08 
 
 
877 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  25.24 
 
 
887 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2939  aminopeptidase N  28.05 
 
 
885 aa  142  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0383897  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  25.45 
 
 
870 aa  141  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  29.82 
 
 
861 aa  141  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2445  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.94 
 
 
617 aa  141  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191901  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1586  aminopeptidase N  29.07 
 
 
852 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109191  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.49 
 
 
485 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  24.47 
 
 
877 aa  140  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5475  aminopeptidase N  24.7 
 
 
894 aa  140  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  28.05 
 
 
851 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0397  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.1 
 
 
722 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244204  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0542  aminopeptidase N  25.59 
 
 
878 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.644765  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.42 
 
 
857 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1803  aminopeptidase N  25.42 
 
 
853 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0680327  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.7 
 
 
516 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0424  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.9 
 
 
722 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>