More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3835 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
470 aa  939    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  85.53 
 
 
471 aa  791    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  48.94 
 
 
527 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  48.03 
 
 
499 aa  398  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  47.27 
 
 
485 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  47.99 
 
 
481 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  46.91 
 
 
485 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  47.94 
 
 
493 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  46.61 
 
 
503 aa  363  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  48.28 
 
 
509 aa  356  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  46.42 
 
 
538 aa  342  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  43.46 
 
 
492 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  43.51 
 
 
506 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  44.24 
 
 
446 aa  333  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  41.38 
 
 
456 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  41.54 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  41.28 
 
 
448 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  40.09 
 
 
442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  41.47 
 
 
442 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  41.94 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  41.94 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  41.06 
 
 
455 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.88 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  41.88 
 
 
492 aa  300  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.35 
 
 
536 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40 
 
 
452 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  42.29 
 
 
429 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.05 
 
 
460 aa  279  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  40.14 
 
 
486 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15070  aminopeptidase N  36.14 
 
 
438 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0867784  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  35.04 
 
 
446 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  36.14 
 
 
473 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33 
 
 
488 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.24 
 
 
673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1698  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  38.89 
 
 
403 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0606871  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.05 
 
 
846 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.97 
 
 
822 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.39 
 
 
863 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.95 
 
 
905 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.85 
 
 
834 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.39 
 
 
858 aa  150  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.28 
 
 
865 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.21 
 
 
823 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.8 
 
 
516 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3712  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.1 
 
 
551 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.63 
 
 
835 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.12 
 
 
573 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.7 
 
 
845 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.94 
 
 
551 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.06 
 
 
517 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.11 
 
 
857 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.11 
 
 
857 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  24.64 
 
 
545 aa  136  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.62 
 
 
866 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.88 
 
 
609 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  27.1 
 
 
688 aa  133  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.94 
 
 
865 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.89 
 
 
822 aa  131  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.67 
 
 
823 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  23.82 
 
 
827 aa  130  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  23.55 
 
 
829 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.72 
 
 
860 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.91 
 
 
824 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.39 
 
 
768 aa  127  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.7 
 
 
687 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  26.5 
 
 
875 aa  124  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.28 
 
 
957 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  25.56 
 
 
848 aa  120  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.28 
 
 
551 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  25.25 
 
 
853 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  25.74 
 
 
853 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  26.16 
 
 
855 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  30.55 
 
 
853 aa  118  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.72 
 
 
821 aa  118  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2867  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.03 
 
 
551 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.930408  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  28.61 
 
 
861 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  29.54 
 
 
856 aa  116  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  27.89 
 
 
862 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1086  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26 
 
 
552 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827108  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  27.69 
 
 
860 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  26.54 
 
 
848 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4040  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.23 
 
 
546 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0316878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4450  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.41 
 
 
547 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.443873  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.78 
 
 
913 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0620443 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.72 
 
 
784 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  30.23 
 
 
861 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.83 
 
 
877 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2876  response regulator receiver protein  24.83 
 
 
604 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000228252  hitchhiker  0.000169705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  25.24 
 
 
918 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02435  peptidase M1 family protein  25.44 
 
 
582 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.872294  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  25.24 
 
 
877 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  25.24 
 
 
877 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2965  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.45 
 
 
597 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  26.77 
 
 
906 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.75 
 
 
686 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.81 
 
 
597 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.27 
 
 
886 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  25.44 
 
 
877 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  28.2 
 
 
867 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  28.2 
 
 
867 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>