More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0340 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
492 aa  985    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  55.53 
 
 
480 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  48.01 
 
 
536 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.08 
 
 
527 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  43.05 
 
 
471 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  39.33 
 
 
481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  41.88 
 
 
470 aa  299  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  42.53 
 
 
538 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  40.32 
 
 
509 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.18 
 
 
499 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  41.69 
 
 
493 aa  289  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  38.91 
 
 
485 aa  285  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  37.8 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  38.94 
 
 
492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  39.22 
 
 
503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  37.64 
 
 
506 aa  276  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  36.66 
 
 
446 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  37.07 
 
 
486 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.74 
 
 
455 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.37 
 
 
452 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.1 
 
 
442 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.15 
 
 
442 aa  193  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.03 
 
 
442 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.03 
 
 
442 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.11 
 
 
448 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  32.16 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.4 
 
 
456 aa  190  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.72 
 
 
473 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.71 
 
 
460 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.4 
 
 
488 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1698  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  38.22 
 
 
403 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0606871  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.35 
 
 
458 aa  180  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.11 
 
 
673 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15070  aminopeptidase N  29.69 
 
 
438 aa  167  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0867784  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  28.67 
 
 
446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.64 
 
 
687 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.7 
 
 
516 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.61 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.54 
 
 
822 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.8 
 
 
865 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26 
 
 
822 aa  125  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.38 
 
 
551 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.6 
 
 
823 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.73 
 
 
863 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.24 
 
 
858 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.49 
 
 
834 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  23.25 
 
 
827 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.52 
 
 
845 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.72 
 
 
573 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1086  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.99 
 
 
552 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827108  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.55 
 
 
865 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.48 
 
 
609 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.33 
 
 
905 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.06 
 
 
768 aa  113  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  24.31 
 
 
829 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.07 
 
 
551 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.55 
 
 
857 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  23.74 
 
 
688 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.55 
 
 
857 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.81 
 
 
860 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.16 
 
 
846 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3712  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.83 
 
 
551 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.67 
 
 
824 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24 
 
 
821 aa  103  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.38 
 
 
866 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2867  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.93 
 
 
551 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.930408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.13 
 
 
957 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.92 
 
 
835 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.81 
 
 
835 aa  96.3  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2742  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.76 
 
 
606 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.280641  hitchhiker  0.000071737 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  27.07 
 
 
905 aa  95.1  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02435  peptidase M1 family protein  22.77 
 
 
582 aa  93.2  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.872294  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  22.8 
 
 
545 aa  91.3  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.28 
 
 
778 aa  89  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.29 
 
 
823 aa  88.2  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0341  lysyl aminopeptidase  22.54 
 
 
846 aa  87.8  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.72 
 
 
854 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  24.93 
 
 
877 aa  87.4  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  26.51 
 
 
681 aa  87  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3448  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.33 
 
 
595 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.06 
 
 
688 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4450  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.87 
 
 
547 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.443873  normal  0.856561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.6 
 
 
784 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  28.18 
 
 
853 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.05 
 
 
933 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2765  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.68 
 
 
593 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  26.51 
 
 
889 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1883  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  24.38 
 
 
843 aa  84.7  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  27.33 
 
 
867 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  27.33 
 
 
867 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.13 
 
 
785 aa  84  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2977  Leukotriene A4 hydrolase  25.84 
 
 
623 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  normal  0.0102393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  22.93 
 
 
853 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  23.46 
 
 
877 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1406  leukotriene A4 hydrolase  26.44 
 
 
623 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.68 
 
 
859 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1561  M1 family peptidase  25.56 
 
 
598 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  22.52 
 
 
906 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.89 
 
 
597 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  24.13 
 
 
853 aa  83.2  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>