More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1912 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
863 aa  1801    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.36 
 
 
859 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  30.63 
 
 
905 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.37 
 
 
877 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.65 
 
 
853 aa  324  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.41 
 
 
859 aa  320  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.11 
 
 
859 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.09 
 
 
857 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  28.52 
 
 
881 aa  313  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  28.19 
 
 
895 aa  305  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6491  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.17 
 
 
929 aa  301  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.1 
 
 
882 aa  299  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.4 
 
 
913 aa  295  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.35 
 
 
830 aa  291  5.0000000000000004e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.33 
 
 
852 aa  288  4e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0347  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.62 
 
 
878 aa  280  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.707127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0335  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.92 
 
 
878 aa  279  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0324  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.93 
 
 
874 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161681  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.07 
 
 
784 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.15 
 
 
933 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.91 
 
 
886 aa  274  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  32.07 
 
 
875 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  26.72 
 
 
870 aa  267  5.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  26.02 
 
 
883 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0504  lysyl aminopeptidase  28.59 
 
 
844 aa  263  6.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.777579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.86 
 
 
932 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.61 
 
 
778 aa  262  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02632  aminopeptidase N  28.61 
 
 
890 aa  261  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.26 
 
 
932 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  26.02 
 
 
849 aa  259  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  29.45 
 
 
844 aa  259  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  35.76 
 
 
890 aa  256  9e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204376 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.26 
 
 
785 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  26.39 
 
 
846 aa  252  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  28.61 
 
 
844 aa  251  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0443  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.21 
 
 
888 aa  251  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.089278  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31787  alanine/arginine aminopeptidase  25.89 
 
 
870 aa  243  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04910  leucyl aminopeptidase, putative  30.35 
 
 
1018 aa  240  6.999999999999999e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1883  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  27.75 
 
 
843 aa  232  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2358  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.94 
 
 
855 aa  232  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.249972  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0341  lysyl aminopeptidase  27.87 
 
 
846 aa  230  7e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.36 
 
 
738 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.604033  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4680  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.36 
 
 
738 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00411  putative aminopeptidase transmembrane protein  29.05 
 
 
748 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5329  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.98 
 
 
727 aa  202  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  27.18 
 
 
849 aa  201  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  29.5 
 
 
852 aa  200  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  32.81 
 
 
853 aa  197  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  33.06 
 
 
848 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  30.2 
 
 
868 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  32.88 
 
 
853 aa  192  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3156  Membrane alanyl aminopeptidase  27.04 
 
 
743 aa  190  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315095  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  35.07 
 
 
853 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  27.06 
 
 
875 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  28.09 
 
 
850 aa  188  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2945  M1 family peptidase  25.62 
 
 
740 aa  187  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2903  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.02 
 
 
723 aa  187  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  30.21 
 
 
862 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  27.07 
 
 
906 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0466  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.92 
 
 
722 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.470213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.38 
 
 
835 aa  185  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  25.58 
 
 
877 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  30.39 
 
 
853 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3622  peptidase  25.7 
 
 
746 aa  184  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  29.46 
 
 
868 aa  184  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  28.4 
 
 
849 aa  184  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  28.8 
 
 
858 aa  184  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  0.0000185174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.72 
 
 
722 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.476849  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0424  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.26 
 
 
722 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  30.84 
 
 
858 aa  184  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1727  M1 family peptidase  25.7 
 
 
721 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3637  M1 family peptidase  25.7 
 
 
721 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3613  M1 family peptidase  25.7 
 
 
721 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2818  M1 family peptidase  25.7 
 
 
721 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.316749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  29.39 
 
 
860 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3161  M1 family peptidase  25.7 
 
 
721 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2613  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.72 
 
 
722 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0397  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.26 
 
 
722 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0040  M1 family peptidase  25.7 
 
 
721 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  29.45 
 
 
865 aa  182  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  25.75 
 
 
877 aa  183  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  25.75 
 
 
877 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3582  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.53 
 
 
722 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.564307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  28.71 
 
 
853 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  31.91 
 
 
854 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  28.91 
 
 
877 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  33.88 
 
 
887 aa  180  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.43 
 
 
869 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  28.26 
 
 
861 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  30.08 
 
 
889 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  25.2 
 
 
877 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  27.2 
 
 
855 aa  179  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  28.67 
 
 
877 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  23.14 
 
 
879 aa  178  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  26.82 
 
 
855 aa  178  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  31.59 
 
 
853 aa  178  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  29.01 
 
 
918 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  28.67 
 
 
877 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  29.1 
 
 
882 aa  177  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  28.44 
 
 
877 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>