241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1086 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02435  peptidase M1 family protein  56.07 
 
 
582 aa  649    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.872294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4450  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  67.98 
 
 
547 aa  787    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.443873  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1086  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
552 aa  1155    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827108  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2868  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  57.97 
 
 
551 aa  689    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.307496  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2867  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  60.51 
 
 
551 aa  722    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.930408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4040  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  57.25 
 
 
546 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0316878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3712  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  52.01 
 
 
551 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4900  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  43.37 
 
 
558 aa  483  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  37.68 
 
 
545 aa  385  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.08 
 
 
957 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.32 
 
 
573 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.56 
 
 
609 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.75 
 
 
673 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  27.95 
 
 
446 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.29 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.9 
 
 
834 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.6 
 
 
687 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.57 
 
 
448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.54 
 
 
503 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.82 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.86 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.86 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.38 
 
 
460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.62 
 
 
442 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  25.78 
 
 
485 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.01 
 
 
458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.99 
 
 
492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.41 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1698  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.86 
 
 
403 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0606871  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26 
 
 
470 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.98 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.55 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.57 
 
 
485 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.04 
 
 
452 aa  110  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.86 
 
 
488 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  29.39 
 
 
446 aa  110  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.93 
 
 
527 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  25.06 
 
 
429 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.43 
 
 
456 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.82 
 
 
865 aa  106  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.48 
 
 
538 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.9 
 
 
857 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  25.45 
 
 
480 aa  105  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.9 
 
 
857 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15070  aminopeptidase N  24.55 
 
 
438 aa  103  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0867784  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.11 
 
 
481 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.69 
 
 
516 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.18 
 
 
845 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.38 
 
 
473 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.21 
 
 
824 aa  98.6  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.45 
 
 
866 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.6 
 
 
551 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  22.47 
 
 
509 aa  97.4  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.38 
 
 
858 aa  97.1  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.32 
 
 
536 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.83 
 
 
821 aa  95.9  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.42 
 
 
860 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.96 
 
 
486 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.24 
 
 
492 aa  93.6  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.58 
 
 
823 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.27 
 
 
517 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.9 
 
 
822 aa  90.5  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.39 
 
 
905 aa  90.5  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.28 
 
 
865 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.2 
 
 
822 aa  87  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.86 
 
 
835 aa  86.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.4 
 
 
863 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  23.98 
 
 
827 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.87 
 
 
506 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.19 
 
 
823 aa  77.4  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.87 
 
 
504 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.9 
 
 
768 aa  75.5  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  23.55 
 
 
829 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.64 
 
 
696 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  27.74 
 
 
854 aa  73.9  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1883  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  23.22 
 
 
843 aa  72  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  24.45 
 
 
688 aa  72  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.93 
 
 
859 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.53 
 
 
932 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.82 
 
 
932 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  25.45 
 
 
856 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.7 
 
 
846 aa  67.4  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.24 
 
 
863 aa  66.6  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2742  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.23 
 
 
606 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.280641  hitchhiker  0.000071737 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  25.56 
 
 
853 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  27.33 
 
 
862 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.17 
 
 
686 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0397  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.58 
 
 
722 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  24.93 
 
 
877 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  26.5 
 
 
861 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0424  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.58 
 
 
722 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  24.85 
 
 
877 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  24.85 
 
 
877 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  25.45 
 
 
889 aa  63.9  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  24.85 
 
 
918 aa  63.9  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  25.21 
 
 
848 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  22.06 
 
 
905 aa  63.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.73 
 
 
504 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.26 
 
 
869 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.79 
 
 
933 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>