More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0293 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  77.78 
 
 
504 aa  792    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
504 aa  1017    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  44.47 
 
 
506 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.42 
 
 
480 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.69 
 
 
518 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  27.23 
 
 
489 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.88 
 
 
482 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.68 
 
 
559 aa  136  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.94 
 
 
492 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.66 
 
 
446 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.18 
 
 
619 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  24.31 
 
 
603 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  23.85 
 
 
628 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.04 
 
 
640 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.88 
 
 
649 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.76 
 
 
517 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  26.14 
 
 
485 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  21.67 
 
 
1079 aa  96.3  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  23.23 
 
 
1026 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  27.11 
 
 
690 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.57 
 
 
448 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  25.68 
 
 
446 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.19 
 
 
456 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.83 
 
 
536 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.87 
 
 
442 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.13 
 
 
458 aa  90.9  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  20.76 
 
 
526 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  26.77 
 
 
681 aa  90.1  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.26 
 
 
857 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.68 
 
 
485 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.26 
 
 
857 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  24.38 
 
 
429 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.65 
 
 
473 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.57 
 
 
673 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.09 
 
 
620 aa  87  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  19.07 
 
 
922 aa  84.7  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  29.85 
 
 
670 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  24.41 
 
 
1103 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1086  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.87 
 
 
552 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827108  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.74 
 
 
460 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.37 
 
 
551 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.27 
 
 
573 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.05 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.53 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.05 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.81 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.41 
 
 
499 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35380  aminopeptidase N  26.22 
 
 
480 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.67 
 
 
471 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  23.44 
 
 
1185 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  23.08 
 
 
1185 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  22.37 
 
 
775 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2977  Leukotriene A4 hydrolase  26.79 
 
 
623 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  normal  0.0102393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1406  leukotriene A4 hydrolase  27.01 
 
 
623 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.06 
 
 
869 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  31.28 
 
 
647 aa  77.8  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1188  hypothetical protein  27.03 
 
 
1186 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  29.25 
 
 
671 aa  77.8  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.89 
 
 
866 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1383  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.98 
 
 
623 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  21.46 
 
 
877 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2965  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.67 
 
 
597 aa  77  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  21.43 
 
 
778 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  21.46 
 
 
918 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  21.46 
 
 
877 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  21.46 
 
 
877 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  22.71 
 
 
1185 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.75 
 
 
452 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.67 
 
 
597 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.9 
 
 
865 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.35 
 
 
688 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1367  leukotriene A4 hydrolase  27.05 
 
 
623 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836195  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  22.71 
 
 
1185 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.53 
 
 
834 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  24.18 
 
 
883 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.68 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.567205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.96 
 
 
516 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  27.4 
 
 
643 aa  75.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3448  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.64 
 
 
595 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.93 
 
 
683 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2742  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.27 
 
 
606 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.280641  hitchhiker  0.000071737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3111  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.84 
 
 
633 aa  75.1  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  27.27 
 
 
1194 aa  75.1  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.14 
 
 
689 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.74 
 
 
882 aa  74.7  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13602  predicted protein  29.78 
 
 
620 aa  74.7  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0213622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  22.6 
 
 
877 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  24.89 
 
 
877 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1561  M1 family peptidase  26.98 
 
 
598 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.42 
 
 
612 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.19072  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.88 
 
 
854 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.42 
 
 
835 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2765  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.51 
 
 
593 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.61 
 
 
527 aa  73.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  27.65 
 
 
895 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.15 
 
 
877 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  25.34 
 
 
877 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  23.78 
 
 
668 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  23.19 
 
 
655 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>