More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1386 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1386  peptidase M28  100 
 
 
736 aa  1511    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000135431  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  42.51 
 
 
1103 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.53 
 
 
688 aa  335  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  35.96 
 
 
696 aa  323  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  31.69 
 
 
681 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  35.7 
 
 
690 aa  307  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.87 
 
 
683 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.27 
 
 
689 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.81 
 
 
702 aa  275  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1703  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.33 
 
 
717 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.023595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1084  Aminopeptidase N-like protein  31.8 
 
 
658 aa  219  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1441  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.14 
 
 
661 aa  174  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.85 
 
 
822 aa  103  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.16 
 
 
823 aa  92  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.21 
 
 
828 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.59 
 
 
865 aa  84.7  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.28 
 
 
551 aa  84.7  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.75 
 
 
821 aa  84  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.46 
 
 
822 aa  82  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.1 
 
 
517 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.2 
 
 
835 aa  82  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.91 
 
 
863 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.4 
 
 
824 aa  80.9  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.22 
 
 
845 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  25.97 
 
 
856 aa  79  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  23.33 
 
 
867 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.73 
 
 
480 aa  79  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  24.45 
 
 
889 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  23.33 
 
 
867 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  23.33 
 
 
867 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.76 
 
 
768 aa  78.2  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  24.2 
 
 
829 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.38 
 
 
857 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.71 
 
 
834 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.38 
 
 
857 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.02 
 
 
823 aa  76.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.64 
 
 
673 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.61 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  24.25 
 
 
862 aa  73.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  24.78 
 
 
861 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  23.82 
 
 
889 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  26.48 
 
 
849 aa  72  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.53 
 
 
846 aa  71.6  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2536  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.66 
 
 
698 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.24 
 
 
573 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.4 
 
 
865 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.91 
 
 
858 aa  70.1  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  23.12 
 
 
446 aa  70.5  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4053  aminopeptidase N  25 
 
 
847 aa  70.1  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339563  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.39 
 
 
499 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.61 
 
 
835 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0692  aminopeptidase N  26.22 
 
 
882 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625099  normal  0.73925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0542  aminopeptidase N  25.32 
 
 
878 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.644765  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1982  aminopeptidase N  25.88 
 
 
851 aa  68.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1912  aminopeptidase N  24.35 
 
 
867 aa  68.6  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.57 
 
 
866 aa  68.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.19 
 
 
504 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2368  aminopeptidase N  25.65 
 
 
874 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0340  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.77 
 
 
492 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.04 
 
 
471 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3270  aminopeptidase N  23.58 
 
 
871 aa  67  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0194  aminopeptidase N  24.17 
 
 
888 aa  67  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  23.82 
 
 
869 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0513  aminopeptidase N  25 
 
 
878 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  24.28 
 
 
851 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0267  aminopeptidase N  26.07 
 
 
894 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341125  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.06 
 
 
518 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2227  aminopeptidase N  28.3 
 
 
878 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.303627  normal  0.186729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.86 
 
 
448 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0754  aminopeptidase N  23.1 
 
 
867 aa  65.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2067  aminopeptidase N  27.25 
 
 
880 aa  65.1  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149086  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1238  aminopeptidase N  25.23 
 
 
871 aa  65.1  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  24.6 
 
 
838 aa  64.7  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1223  aminopeptidase N  25.68 
 
 
851 aa  65.1  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.336507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0476  aminopeptidase N  25.3 
 
 
878 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.59204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1078  M1 family peptidase  26.36 
 
 
598 aa  64.3  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000177882  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10001  aminopeptidase N  22.84 
 
 
872 aa  64.3  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.92 
 
 
905 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.94 
 
 
559 aa  63.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0706  aminopeptidase N  24.59 
 
 
854 aa  63.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.281728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.97 
 
 
492 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.89 
 
 
485 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3081  aminopeptidase N  25.9 
 
 
851 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  23.26 
 
 
855 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5475  aminopeptidase N  25.43 
 
 
894 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  25.15 
 
 
848 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.14 
 
 
506 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  24.11 
 
 
887 aa  63.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.41 
 
 
506 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2229  aminopeptidase N-like  21.12 
 
 
814 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.325655  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0475  aminopeptidase N  24.11 
 
 
864 aa  62.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.392595  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  26.22 
 
 
870 aa  63.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  21.74 
 
 
863 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.98 
 
 
860 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  22.93 
 
 
906 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2187  aminopeptidase N  23.19 
 
 
870 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.739046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.38 
 
 
470 aa  62.4  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2662  aminopeptidase N  24.5 
 
 
883 aa  62.4  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1094  aminopeptidase N  23.19 
 
 
870 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0163604  normal  0.415463 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1041  aminopeptidase N  23.19 
 
 
870 aa  62  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.230058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>