61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1188 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1751  hypothetical protein  64.92 
 
 		 1185 aa  1650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  65.18 
 
 		 1185 aa  1665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  38.01 
 
 		 1194 aa  767    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0074  hypothetical protein  37.44 
 
 		 1216 aa  763    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  65.35 
 
 		 1185 aa  1664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  65.51 
 
 		 1185 aa  1668    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  65.09 
 
 		 1185 aa  1665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1188  hypothetical protein  100 
 
 		 1186 aa  2437    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2630  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1194 aa  826    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4874  hypothetical protein  31.57 
 
 		 1215 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.70631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5233  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.21 
 
 		 1162 aa  496  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1979  aminopeptidase N-like protein  26.44 
 
 		 1179 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.89 
 
 		 480 aa  84.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3210  hypothetical protein  25 
 
 		 758 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336034  hitchhiker  0.00714683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.79 
 
 		 504 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.03 
 
 		 504 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.17 
 
 		 846 aa  65.1  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.18 
 
 		 506 aa  61.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  23.61 
 
 		 690 aa  59.7  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.41 
 
 		 688 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.24 
 
 		 551 aa  60.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.9 
 
 		 823 aa  58.5  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  24.84 
 
 		 922 aa  58.2  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.23 
 
 		 559 aa  57.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  23.65 
 
 		 681 aa  57.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.13 
 
 		 834 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.29 
 
 		 865 aa  56.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.74 
 
 		 649 aa  56.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.34 
 
 		 835 aa  54.3  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  21.56 
 
 		 688 aa  54.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3199  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.96 
 
 		 609 aa  54.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179758  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.68 
 
 		 686 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.13 
 
 		 485 aa  53.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  22.46 
 
 		 829 aa  53.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.81 
 
 		 683 aa  52  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.81 
 
 		 854 aa  52  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.31 
 
 		 696 aa  51.6  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.72 
 
 		 863 aa  51.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.46 
 
 		 499 aa  51.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.68 
 
 		 866 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.57 
 
 		 821 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.04 
 
 		 824 aa  49.7  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3592  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.17 
 
 		 648 aa  49.7  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.92 
 
 		 822 aa  49.7  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23 
 
 		 860 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.01 
 
 		 518 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.42 
 
 		 957 aa  49.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2445  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.47 
 
 		 617 aa  48.1  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191901  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  22.85 
 
 		 446 aa  48.1  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.14 
 
 		 822 aa  47.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.56 
 
 		 828 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.67 
 
 		 857 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  23.29 
 
 		 545 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.67 
 
 		 857 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  26.53 
 
 		 875 aa  45.8  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  22.11 
 
 		 827 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.14 
 
 		 858 aa  45.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15070  aminopeptidase N  24.68 
 
 		 438 aa  45.1  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0867784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.82 
 
 		 845 aa  45.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.46 
 
 		 689 aa  45.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  21.55 
 
 		 887 aa  44.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>