42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3210 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3210  hypothetical protein  100 
 
 		 758 aa  1535    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336034  hitchhiker  0.00714683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1188  hypothetical protein  25 
 
 		 1186 aa  84  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1185 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  25.62 
 
 		 688 aa  72.8  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  20.89 
 
 		 1185 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  20.89 
 
 		 1185 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.41 
 
 		 688 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  22 
 
 		 1185 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5233  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.12 
 
 		 1162 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.42 
 
 		 696 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1751  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1185 aa  66.6  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  24.52 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  24.19 
 
 		 681 aa  64.7  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4874  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1215 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.70631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  23.52 
 
 		 1103 aa  61.6  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1194 aa  61.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.61 
 
 		 683 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2630  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1194 aa  58.9  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.4 
 
 		 689 aa  55.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1979  aminopeptidase N-like protein  26.05 
 
 		 1179 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  25.34 
 
 		 489 aa  54.3  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.14 
 
 		 822 aa  52  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  29.94 
 
 		 922 aa  52  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  22.4 
 
 		 879 aa  51.2  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.8 
 
 		 480 aa  50.8  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0074  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1216 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1084  Aminopeptidase N-like protein  25.85 
 
 		 658 aa  50.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.01 
 
 		 834 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  21.96 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.07 
 
 		 823 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.12 
 
 		 486 aa  48.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.42 
 
 		 824 aa  47.8  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.26 
 
 		 821 aa  47  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.45 
 
 		 482 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  20.73 
 
 		 887 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1918  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.37 
 
 		 421 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.491316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  20.2 
 
 		 429 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.84 
 
 		 518 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.09 
 
 		 702 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.97 
 
 		 905 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 		 442 aa  44.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.36 
 
 		 858 aa  44.3  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>