87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3347 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  100 
 
 
631 aa  1315    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  50.72 
 
 
623 aa  631  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  37.32 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  31.32 
 
 
663 aa  296  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  30.87 
 
 
732 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  30.83 
 
 
666 aa  250  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  28.59 
 
 
638 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  27.39 
 
 
900 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  29.55 
 
 
655 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  29.55 
 
 
655 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  30.74 
 
 
838 aa  223  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  29.56 
 
 
655 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  29.39 
 
 
655 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  30.51 
 
 
775 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  28.98 
 
 
792 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  29.02 
 
 
668 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  30.76 
 
 
770 aa  216  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  31 
 
 
778 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  28.23 
 
 
756 aa  214  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  29.03 
 
 
745 aa  210  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  27.86 
 
 
689 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  29.35 
 
 
792 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  28.49 
 
 
793 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  28.72 
 
 
816 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  26.99 
 
 
818 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.51 
 
 
821 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  28.7 
 
 
801 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  30.11 
 
 
811 aa  183  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  25.35 
 
 
815 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.95 
 
 
619 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  24.91 
 
 
603 aa  153  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  24.26 
 
 
1079 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  26.21 
 
 
1026 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.21 
 
 
640 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  25.9 
 
 
526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  25.35 
 
 
628 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.57 
 
 
620 aa  125  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.79 
 
 
649 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.14 
 
 
480 aa  87.4  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.79 
 
 
822 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.57 
 
 
824 aa  75.1  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.64 
 
 
823 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.64 
 
 
821 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.42 
 
 
768 aa  67  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.78 
 
 
504 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.27 
 
 
860 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.19 
 
 
857 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.19 
 
 
857 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.92 
 
 
482 aa  58.9  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.96 
 
 
858 aa  58.9  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.11 
 
 
866 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  20.4 
 
 
489 aa  57  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.28 
 
 
823 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.77 
 
 
905 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.07 
 
 
863 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.83 
 
 
504 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.63 
 
 
846 aa  53.9  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  24.36 
 
 
688 aa  53.9  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.54 
 
 
865 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
506 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.28 
 
 
835 aa  53.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.31 
 
 
834 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.68 
 
 
492 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.92 
 
 
845 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.45 
 
 
686 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  22.58 
 
 
829 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.35 
 
 
865 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.35 
 
 
688 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  22.22 
 
 
827 aa  48.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.36 
 
 
517 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  26.24 
 
 
681 aa  47.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.95 
 
 
527 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  25 
 
 
690 aa  47.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.14 
 
 
485 aa  47.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  20.59 
 
 
1185 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  20.59 
 
 
1185 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  20.59 
 
 
1185 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.23 
 
 
458 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.34 
 
 
516 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10018  Aminopeptidase N  25.23 
 
 
937 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.1 
 
 
442 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.64 
 
 
471 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.26 
 
 
784 aa  45.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.31 
 
 
518 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.83 
 
 
456 aa  44.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  23.81 
 
 
877 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  19.41 
 
 
1185 aa  43.5  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>