More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2765 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1561  M1 family peptidase  67.45 
 
 
598 aa  814    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1406  leukotriene A4 hydrolase  68.14 
 
 
623 aa  849    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2977  Leukotriene A4 hydrolase  67.49 
 
 
623 aa  840    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  normal  0.0102393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  67 
 
 
612 aa  818    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.19072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1383  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  67.98 
 
 
623 aa  841    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2965  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  64.7 
 
 
597 aa  798    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2742  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  66.72 
 
 
606 aa  814    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.280641  hitchhiker  0.000071737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2706  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  68.47 
 
 
605 aa  830    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000383424  hitchhiker  0.0000144505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2774  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  68.47 
 
 
605 aa  828    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000499595  decreased coverage  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2765  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
593 aa  1230    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1367  leukotriene A4 hydrolase  67.65 
 
 
623 aa  842    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836195  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2876  response regulator receiver protein  68.07 
 
 
604 aa  824    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000228252  hitchhiker  0.000169705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  66.39 
 
 
597 aa  819    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1078  M1 family peptidase  62.71 
 
 
598 aa  753    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000177882  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3448  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  67.34 
 
 
595 aa  832    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3111  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  47.3 
 
 
633 aa  555  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  45.74 
 
 
643 aa  537  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1997  M1 family peptidase  47.01 
 
 
628 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2339  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  46.84 
 
 
642 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2267  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  46.5 
 
 
642 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283529  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2457  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  45.98 
 
 
642 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.982771  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3470  neutral zinc metallopeptidase M1 family protein  42.47 
 
 
629 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  44.67 
 
 
670 aa  495  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2589  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  44.07 
 
 
647 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000915199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1757  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  44.01 
 
 
647 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000341023  normal  0.0233957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2628  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  44.14 
 
 
647 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2703  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  44.35 
 
 
647 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000156716  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2314  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  44.18 
 
 
652 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00696087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3459  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  42.93 
 
 
642 aa  488  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  42.57 
 
 
671 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  42.4 
 
 
647 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2445  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.55 
 
 
617 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191901  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3592  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  39.77 
 
 
648 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1551  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  38.57 
 
 
615 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.043081  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13602  predicted protein  35.39 
 
 
620 aa  337  5e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0213622  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05812  Leukotriene A-4 hydrolase (EC 3.3.2.6)(Leukotriene A(4) hydrolase)(LTA-4 hydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0W8]  33.67 
 
 
618 aa  296  6e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82220  Probable leukotriene A-4 hydrolase (LTA-4 hydrolase) (Leukotriene A(4) hydrolase)  31.14 
 
 
635 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.126377 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76777  leukotriene A-4 hydrolase (LTA-4 hydrolase) (Leukotriene A(4) hydrolase)  30.74 
 
 
626 aa  239  8e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937224  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04600  leukotriene-A4 hydrolase, putative  33.55 
 
 
479 aa  219  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0099794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.26 
 
 
516 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.38 
 
 
821 aa  128  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.74 
 
 
822 aa  125  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.76 
 
 
824 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.62 
 
 
551 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.76 
 
 
823 aa  116  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.89 
 
 
460 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.51 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.62 
 
 
835 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
857 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30 
 
 
778 aa  110  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.82 
 
 
857 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  27.76 
 
 
688 aa  110  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.06 
 
 
860 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.53 
 
 
865 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  23.25 
 
 
429 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6491  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.06 
 
 
929 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.44 
 
 
846 aa  107  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  25.14 
 
 
827 aa  107  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.33 
 
 
866 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
835 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.72 
 
 
859 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.07 
 
 
823 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  26.27 
 
 
829 aa  105  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.35 
 
 
834 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.45 
 
 
863 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.82 
 
 
905 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.35 
 
 
499 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  25.78 
 
 
862 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.47 
 
 
830 aa  103  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.65 
 
 
785 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.46 
 
 
673 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  26.24 
 
 
905 aa  100  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  22.53 
 
 
485 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.5 
 
 
784 aa  98.6  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
865 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.78 
 
 
822 aa  98.6  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.96 
 
 
877 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.09 
 
 
456 aa  97.8  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  26.88 
 
 
861 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5329  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.59 
 
 
727 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.1 
 
 
854 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  23.27 
 
 
446 aa  95.1  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.16 
 
 
858 aa  95.5  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.5 
 
 
768 aa  94.7  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.11 
 
 
845 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  23.15 
 
 
446 aa  94.4  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1058  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.98 
 
 
481 aa  94  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  24.79 
 
 
906 aa  94  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.38 
 
 
458 aa  94  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.39 
 
 
485 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  25.86 
 
 
848 aa  92  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1494  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.62 
 
 
452 aa  92  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  29.06 
 
 
875 aa  92  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2358  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.63 
 
 
855 aa  91.3  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.249972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  25 
 
 
853 aa  91.3  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2903  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.45 
 
 
723 aa  91.3  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  23.78 
 
 
889 aa  90.9  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.93 
 
 
470 aa  90.9  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.84 
 
 
442 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.84 
 
 
442 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>