More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1781 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  100 
 
 
838 aa  1740    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  45.93 
 
 
821 aa  637    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  44.72 
 
 
816 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  43.29 
 
 
793 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  43.25 
 
 
801 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  43.69 
 
 
792 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  41.92 
 
 
792 aa  608  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  43.04 
 
 
815 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  41.36 
 
 
775 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  42.84 
 
 
818 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  39.52 
 
 
778 aa  581  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  41.5 
 
 
811 aa  580  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  41.42 
 
 
770 aa  576  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  40.21 
 
 
745 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  39.54 
 
 
638 aa  361  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  39.42 
 
 
666 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  38.46 
 
 
689 aa  343  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  35.24 
 
 
756 aa  333  7.000000000000001e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  34.96 
 
 
655 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  34.96 
 
 
655 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  34.79 
 
 
655 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  33.89 
 
 
668 aa  312  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  34.96 
 
 
655 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  34.9 
 
 
900 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  35.87 
 
 
732 aa  300  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  33.22 
 
 
663 aa  250  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  30.74 
 
 
631 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  29.55 
 
 
610 aa  218  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  29.05 
 
 
526 aa  197  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  28.24 
 
 
623 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.2 
 
 
619 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.57 
 
 
620 aa  177  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  27.93 
 
 
603 aa  174  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  27.73 
 
 
1079 aa  168  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  27.61 
 
 
1026 aa  162  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  25.78 
 
 
628 aa  157  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.33 
 
 
640 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.24 
 
 
649 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.66 
 
 
480 aa  104  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  23.88 
 
 
887 aa  88.2  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.88 
 
 
482 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.21 
 
 
506 aa  83.2  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.17 
 
 
878 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  24.27 
 
 
877 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  23.53 
 
 
889 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  24.27 
 
 
877 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  24.27 
 
 
918 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  24.27 
 
 
877 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  24.27 
 
 
877 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  24.27 
 
 
877 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  23.43 
 
 
877 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.46 
 
 
846 aa  79  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  23.85 
 
 
877 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  23.01 
 
 
877 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.29 
 
 
821 aa  77.4  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.32 
 
 
823 aa  76.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  23.38 
 
 
875 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.33 
 
 
768 aa  75.9  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.39 
 
 
504 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.79 
 
 
822 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.84 
 
 
857 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.79 
 
 
824 aa  73.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.37 
 
 
863 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.84 
 
 
857 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  23.94 
 
 
870 aa  70.9  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.03 
 
 
834 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.55 
 
 
823 aa  69.3  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  25.21 
 
 
881 aa  68.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  23.26 
 
 
879 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  25.63 
 
 
827 aa  68.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  26.53 
 
 
858 aa  67.4  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.55 
 
 
835 aa  67.4  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  26.91 
 
 
853 aa  67.4  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.35 
 
 
822 aa  65.1  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  22.94 
 
 
829 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  28.92 
 
 
688 aa  65.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  27.51 
 
 
862 aa  64.7  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
860 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.17 
 
 
538 aa  64.3  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  27.35 
 
 
853 aa  63.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  21.96 
 
 
489 aa  62  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3459  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.4 
 
 
642 aa  62  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.45 
 
 
858 aa  60.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1883  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  22.92 
 
 
843 aa  60.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  22.37 
 
 
906 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.63 
 
 
686 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.57 
 
 
492 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.3 
 
 
852 aa  58.9  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  30 
 
 
853 aa  58.9  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2965  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.79 
 
 
597 aa  58.9  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.19 
 
 
859 aa  57.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.72 
 
 
597 aa  57.4  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  23.35 
 
 
871 aa  57.4  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.48 
 
 
845 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.69 
 
 
673 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  29.3 
 
 
670 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  23.98 
 
 
869 aa  56.2  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.22 
 
 
854 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  23.35 
 
 
842 aa  55.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.61 
 
 
905 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>