More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1149 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  50.57 
 
 		 868 aa  805    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  44.33 
 
 		 861 aa  671    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  46.59 
 
 		 849 aa  733    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  43.82 
 
 		 858 aa  687    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  49.77 
 
 		 853 aa  802    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  46.69 
 
 		 846 aa  709    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  45.44 
 
 		 858 aa  720    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  0.0000185174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  45.86 
 
 		 887 aa  692    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  45.67 
 
 		 855 aa  718    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  45.91 
 
 		 850 aa  719    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  41.26 
 
 		 848 aa  656    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  44.61 
 
 		 856 aa  687    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  52.18 
 
 		 865 aa  830    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  43.57 
 
 		 848 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  51.15 
 
 		 862 aa  838    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  69.89 
 
 		 869 aa  1256    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  44.29 
 
 		 867 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  100 
 
 		 871 aa  1798    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  43.15 
 
 		 851 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  44.32 
 
 		 862 aa  668    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  46.41 
 
 		 854 aa  709    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  44.16 
 
 		 853 aa  652    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  50.17 
 
 		 853 aa  801    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  44.85 
 
 		 861 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2129  aminopeptidase G  42.7 
 
 		 876 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  48.55 
 
 		 853 aa  769    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  51.39 
 
 		 849 aa  854    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  47.71 
 
 		 868 aa  719    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  51.66 
 
 		 850 aa  860    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  43.84 
 
 		 863 aa  694    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  45.73 
 
 		 855 aa  717    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  45.66 
 
 		 852 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  44.29 
 
 		 867 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  45.4 
 
 		 889 aa  697    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  45.28 
 
 		 869 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  44.72 
 
 		 860 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  44.18 
 
 		 867 aa  680    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  41.64 
 
 		 851 aa  634  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  42.96 
 
 		 862 aa  617  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  41.38 
 
 		 848 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  41.78 
 
 		 874 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  39.46 
 
 		 882 aa  578  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24070  aminopeptidase N  38.19 
 
 		 892 aa  569  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  38.93 
 
 		 837 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  38.65 
 
 		 857 aa  527  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  35.93 
 
 		 882 aa  519  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0968  aminopeptidase N  37.5 
 
 		 878 aa  481  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  35.76 
 
 		 838 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  35.92 
 
 		 842 aa  464  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2138  aminopeptidase N  32.72 
 
 		 834 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  37.02 
 
 		 878 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  35.07 
 
 		 887 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  35.7 
 
 		 906 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  35.16 
 
 		 877 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  35.08 
 
 		 877 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  35.29 
 
 		 877 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  31.86 
 
 		 848 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  35.36 
 
 		 889 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  35.41 
 
 		 877 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  35.24 
 
 		 918 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  35.24 
 
 		 877 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  31.82 
 
 		 853 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  35.24 
 
 		 877 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  31.84 
 
 		 853 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  35.24 
 
 		 877 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  33.69 
 
 		 875 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  34.53 
 
 		 877 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  33.47 
 
 		 879 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  33.07 
 
 		 823 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  30.21 
 
 		 807 aa  318  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  32.94 
 
 		 881 aa  231  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.97 
 
 		 785 aa  227  6e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.21 
 
 		 852 aa  219  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1883  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  32.57 
 
 		 843 aa  216  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.68 
 
 		 882 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.22 
 
 		 778 aa  213  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.97 
 
 		 857 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.75 
 
 		 882 aa  212  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  30.02 
 
 		 890 aa  212  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204376 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  30.89 
 
 		 883 aa  210  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04910  leucyl aminopeptidase, putative  34.1 
 
 		 1018 aa  209  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.86 
 
 		 859 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0504  lysyl aminopeptidase  31.7 
 
 		 844 aa  210  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.777579  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.67 
 
 		 784 aa  209  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.08 
 
 		 853 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  31.51 
 
 		 849 aa  205  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  31.49 
 
 		 844 aa  204  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  30.61 
 
 		 844 aa  204  9e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  30.93 
 
 		 870 aa  203  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.95 
 
 		 859 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.73 
 
 		 859 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.04 
 
 		 877 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  33.33 
 
 		 895 aa  198  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.65 
 
 		 886 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.2 
 
 		 854 aa  196  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.62 
 
 		 830 aa  193  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  28.91 
 
 		 905 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  30.72 
 
 		 846 aa  188  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.2 
 
 		 869 aa  188  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02632  aminopeptidase N  31.82 
 
 		 890 aa  188  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>