104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2032 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  100 
 
 
1026 aa  2076    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  41.48 
 
 
619 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  40.54 
 
 
603 aa  474  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  37.85 
 
 
628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  38.7 
 
 
620 aa  442  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  35.77 
 
 
640 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  29.52 
 
 
1079 aa  243  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  33.23 
 
 
638 aa  231  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  29.31 
 
 
526 aa  212  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  30.87 
 
 
663 aa  207  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  27.34 
 
 
655 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  27.16 
 
 
655 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  27.27 
 
 
655 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  27.19 
 
 
655 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  26.65 
 
 
689 aa  191  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  25.16 
 
 
756 aa  188  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  26.67 
 
 
900 aa  188  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  27.09 
 
 
732 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  27.24 
 
 
668 aa  183  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  26.48 
 
 
666 aa  181  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  28.21 
 
 
792 aa  181  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.19 
 
 
649 aa  174  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.05 
 
 
818 aa  170  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  27.49 
 
 
745 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  28.17 
 
 
821 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  23.99 
 
 
775 aa  164  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  26.74 
 
 
815 aa  163  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  29.54 
 
 
811 aa  163  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  26.2 
 
 
801 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.61 
 
 
838 aa  162  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  26.62 
 
 
792 aa  162  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.47 
 
 
816 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  26.22 
 
 
778 aa  154  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.63 
 
 
480 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  24.62 
 
 
793 aa  152  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  28.05 
 
 
610 aa  150  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  25.04 
 
 
770 aa  147  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  26.55 
 
 
631 aa  138  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  23.63 
 
 
623 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.4 
 
 
506 aa  109  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.65 
 
 
482 aa  98.6  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.71 
 
 
492 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.73 
 
 
504 aa  92  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.6 
 
 
504 aa  91.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.68 
 
 
559 aa  87  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  23.08 
 
 
489 aa  85.1  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.74 
 
 
446 aa  82  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.06 
 
 
860 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.01 
 
 
673 aa  71.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.89 
 
 
517 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.37 
 
 
834 aa  68.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.77 
 
 
518 aa  65.1  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.49 
 
 
551 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  19.48 
 
 
922 aa  62.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.34 
 
 
857 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.34 
 
 
857 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.25 
 
 
823 aa  60.8  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10018  Aminopeptidase N  20.99 
 
 
937 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.51 
 
 
846 aa  58.9  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  24.01 
 
 
688 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.13 
 
 
492 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.11 
 
 
866 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2628  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.02 
 
 
647 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000178054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.49 
 
 
516 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.71 
 
 
457 aa  53.5  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.567205  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.84 
 
 
823 aa  52  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24 
 
 
835 aa  52  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2703  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.08 
 
 
647 aa  52  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000156716  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.02 
 
 
858 aa  52  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.73 
 
 
597 aa  51.6  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2589  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.63 
 
 
647 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000915199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1757  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.87 
 
 
647 aa  51.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000341023  normal  0.0233957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.89 
 
 
865 aa  50.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.95 
 
 
768 aa  50.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1386  peptidase M28  24.6 
 
 
736 aa  49.7  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000135431  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3448  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.8 
 
 
595 aa  49.7  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1078  M1 family peptidase  29.93 
 
 
598 aa  48.9  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000177882  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13602  predicted protein  27.22 
 
 
620 aa  48.9  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0213622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.86 
 
 
506 aa  48.9  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0443  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.63 
 
 
888 aa  48.5  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.089278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2457  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.35 
 
 
642 aa  48.5  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.982771  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2706  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.38 
 
 
605 aa  48.1  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000383424  hitchhiker  0.0000144505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2267  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.8 
 
 
642 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283529  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2774  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.38 
 
 
605 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000499595  decreased coverage  0.000305013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  27.56 
 
 
643 aa  47.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2339  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.8 
 
 
642 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2876  response regulator receiver protein  25.56 
 
 
604 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000228252  hitchhiker  0.000169705 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.35 
 
 
822 aa  47.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2965  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.14 
 
 
597 aa  47.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  20.76 
 
 
829 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23 
 
 
905 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1561  M1 family peptidase  28.38 
 
 
598 aa  46.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.51 
 
 
527 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3470  neutral zinc metallopeptidase M1 family protein  28.66 
 
 
629 aa  45.8  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2765  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.04 
 
 
593 aa  45.8  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.01 
 
 
612 aa  45.8  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.19072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  23.99 
 
 
1103 aa  45.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2742  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.05 
 
 
606 aa  45.8  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.280641  hitchhiker  0.000071737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2314  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.44 
 
 
652 aa  45.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00696087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.41 
 
 
845 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>