78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1889 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  100 
 
 
610 aa  1267    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  40.13 
 
 
623 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  37.32 
 
 
631 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  29.48 
 
 
638 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  30.88 
 
 
732 aa  276  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  29.25 
 
 
666 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  28.89 
 
 
663 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  29.34 
 
 
756 aa  263  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  29.28 
 
 
668 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  28.55 
 
 
689 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  28.93 
 
 
900 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  31.63 
 
 
745 aa  237  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  29.23 
 
 
655 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  30.32 
 
 
770 aa  231  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  28.98 
 
 
655 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  28.98 
 
 
655 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.81 
 
 
816 aa  226  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  28.5 
 
 
655 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  28.26 
 
 
811 aa  223  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  26.67 
 
 
821 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  29.67 
 
 
793 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  26.72 
 
 
818 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  29.55 
 
 
838 aa  218  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  30.3 
 
 
792 aa  214  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  28.2 
 
 
792 aa  213  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  27.89 
 
 
801 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  26.65 
 
 
775 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  28.04 
 
 
778 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  25 
 
 
815 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  26.86 
 
 
526 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.16 
 
 
619 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  28.05 
 
 
1026 aa  150  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  25.45 
 
 
1079 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  25.79 
 
 
628 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.43 
 
 
640 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  23.74 
 
 
603 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.56 
 
 
620 aa  111  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.88 
 
 
649 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.27 
 
 
480 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.55 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.4 
 
 
506 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  17.68 
 
 
489 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.75 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.63 
 
 
823 aa  54.3  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.75 
 
 
860 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.42 
 
 
866 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.6 
 
 
458 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.75 
 
 
768 aa  52.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.49 
 
 
865 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.88 
 
 
846 aa  51.2  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.6 
 
 
485 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.97 
 
 
857 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.97 
 
 
857 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.16 
 
 
865 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.76 
 
 
905 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.07 
 
 
448 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.18 
 
 
492 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10018  Aminopeptidase N  26.26 
 
 
937 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.66 
 
 
559 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.62 
 
 
823 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.9 
 
 
442 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  21.69 
 
 
846 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  23.68 
 
 
446 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.38 
 
 
551 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  25.51 
 
 
829 aa  45.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  26.09 
 
 
877 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.64 
 
 
442 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.11 
 
 
821 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.64 
 
 
442 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.08 
 
 
527 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.08 
 
 
686 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0194  aminopeptidase N  27.37 
 
 
888 aa  44.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.62 
 
 
822 aa  44.3  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.34 
 
 
673 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  28.16 
 
 
877 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  28.16 
 
 
877 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  28.16 
 
 
877 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
863 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>