101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0409 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  52.86 
 
 		 792 aa  839    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  100 
 
 		 815 aa  1694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  65.72 
 
 		 816 aa  1114    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  48.13 
 
 		 811 aa  755    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  64.38 
 
 		 818 aa  1071    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  66.09 
 
 		 821 aa  1114    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  47.67 
 
 		 793 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  44.84 
 
 		 778 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  45.63 
 
 		 775 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  46.63 
 
 		 792 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  46.25 
 
 		 801 aa  650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  42.43 
 
 		 838 aa  607  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  42.4 
 
 		 745 aa  597  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  42.86 
 
 		 770 aa  576  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  41.38 
 
 		 638 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  39.05 
 
 		 689 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  37.64 
 
 		 666 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  38.33 
 
 		 756 aa  348  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  35.24 
 
 		 900 aa  345  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  36.46 
 
 		 655 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  36.64 
 
 		 655 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  36.48 
 
 		 655 aa  326  9e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  36.32 
 
 		 655 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  36.61 
 
 		 668 aa  325  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  35.33 
 
 		 732 aa  310  6.999999999999999e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  29.02 
 
 		 663 aa  217  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  25.17 
 
 		 610 aa  205  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.93 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.06 
 
 		 620 aa  186  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  27.39 
 
 		 603 aa  183  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  28.81 
 
 		 628 aa  181  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.65 
 
 		 640 aa  181  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  25.35 
 
 		 631 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.88 
 
 		 619 aa  178  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  26.74 
 
 		 1026 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  27.05 
 
 		 1079 aa  150  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  25.79 
 
 		 623 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.2 
 
 		 649 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.23 
 
 		 480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.35 
 
 		 482 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.37 
 
 		 504 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  25.42 
 
 		 887 aa  65.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  22.01 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  25.93 
 
 		 875 aa  63.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.26 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.6 
 
 		 857 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.54 
 
 		 846 aa  59.7  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.98 
 
 		 857 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.64 
 
 		 768 aa  58.9  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  26.22 
 
 		 877 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  25.61 
 
 		 877 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  25.61 
 
 		 877 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  26.22 
 
 		 877 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  26.22 
 
 		 877 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  26.22 
 
 		 918 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  26.22 
 
 		 877 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  26.22 
 
 		 877 aa  55.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.39 
 
 		 878 aa  55.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.98 
 
 		 860 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.1 
 
 		 835 aa  54.3  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  25.43 
 
 		 877 aa  53.9  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.67 
 
 		 821 aa  53.5  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.09 
 
 		 517 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.6 
 
 		 471 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.35 
 
 		 559 aa  52  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.92 
 
 		 823 aa  51.6  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.81 
 
 		 822 aa  52  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.77 
 
 		 863 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  22.97 
 
 		 889 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.87 
 
 		 823 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.67 
 
 		 824 aa  50.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.76 
 
 		 905 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.37 
 
 		 488 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  22.36 
 
 		 881 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1883  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  22.86 
 
 		 843 aa  48.1  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  23.64 
 
 		 829 aa  48.1  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.49 
 
 		 492 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0504  lysyl aminopeptidase  23.67 
 
 		 844 aa  47.8  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.777579  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05812  Leukotriene A-4 hydrolase (EC 3.3.2.6)(Leukotriene A(4) hydrolase)(LTA-4 hydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0W8]  25.49 
 
 		 618 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  26.67 
 
 		 670 aa  47.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.22 
 
 		 822 aa  47.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.32 
 
 		 485 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.65 
 
 		 673 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.46 
 
 		 858 aa  47  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  24.14 
 
 		 879 aa  46.6  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.86 
 
 		 859 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.53 
 
 		 446 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.94 
 
 		 866 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0739  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.86 
 
 		 887 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 		 470 aa  46.2  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.04 
 
 		 686 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.22 
 
 		 551 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.79 
 
 		 493 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  22.17 
 
 		 849 aa  45.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4500  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.62 
 
 		 473 aa  45.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.567282  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  22.12 
 
 		 844 aa  45.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  23.84 
 
 		 848 aa  45.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.69 
 
 		 877 aa  45.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  23.01 
 
 		 870 aa  45.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  23.89 
 
 		 853 aa  44.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>