118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4234 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  63.67 
 
 		 792 aa  1007    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  51.27 
 
 		 792 aa  765    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  47.3 
 
 		 815 aa  679    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  48.57 
 
 		 816 aa  708    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  45.67 
 
 		 811 aa  653    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  49.67 
 
 		 745 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  46.8 
 
 		 818 aa  680    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  43.34 
 
 		 838 aa  652    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  70.83 
 
 		 801 aa  1150    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  48.05 
 
 		 821 aa  717    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  48.1 
 
 		 770 aa  709    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  100 
 
 		 793 aa  1657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  52.48 
 
 		 778 aa  852    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  52.86 
 
 		 775 aa  835    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  44.76 
 
 		 638 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  38.81 
 
 		 689 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  37.48 
 
 		 900 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  38.25 
 
 		 666 aa  360  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  37.94 
 
 		 756 aa  343  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  37.18 
 
 		 732 aa  327  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  36.49 
 
 		 668 aa  327  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  33.61 
 
 		 655 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  34.5 
 
 		 655 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  34.33 
 
 		 655 aa  299  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  34.15 
 
 		 655 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  31.36 
 
 		 663 aa  242  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  29.72 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  29.36 
 
 		 526 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  27.92 
 
 		 631 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.12 
 
 		 619 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  27.08 
 
 		 623 aa  174  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.72 
 
 		 640 aa  161  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  26.29 
 
 		 1079 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.43 
 
 		 620 aa  157  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  25.92 
 
 		 603 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  24.62 
 
 		 1026 aa  152  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  26.51 
 
 		 628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.57 
 
 		 649 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.91 
 
 		 480 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.44 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.99 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.29 
 
 		 482 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.38 
 
 		 863 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.68 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.49 
 
 		 823 aa  58.5  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.32 
 
 		 835 aa  58.5  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.42 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.87 
 
 		 822 aa  58.2  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.44 
 
 		 446 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.32 
 
 		 824 aa  57  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  24.86 
 
 		 887 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.51 
 
 		 504 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.32 
 
 		 878 aa  55.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.27 
 
 		 518 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.84 
 
 		 846 aa  55.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  28.95 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.77 
 
 		 686 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.66 
 
 		 768 aa  54.3  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  19.81 
 
 		 489 aa  54.3  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  21.49 
 
 		 870 aa  54.3  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.05 
 
 		 702 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.58 
 
 		 559 aa  53.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  22.82 
 
 		 877 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.87 
 
 		 485 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.45 
 
 		 471 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  24.35 
 
 		 827 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  23.04 
 
 		 889 aa  52  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.05 
 
 		 492 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.09 
 
 		 538 aa  51.6  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  22.97 
 
 		 881 aa  51.2  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.32 
 
 		 493 aa  50.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23 
 
 		 823 aa  50.8  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.83 
 
 		 517 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.5 
 
 		 527 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.88 
 
 		 834 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  21.36 
 
 		 877 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  21.36 
 
 		 877 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1551  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.86 
 
 		 615 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.043081  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  21.67 
 
 		 829 aa  48.9  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  21.43 
 
 		 875 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  24.63 
 
 		 906 aa  48.5  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  26.94 
 
 		 882 aa  48.5  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.54 
 
 		 551 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  21.84 
 
 		 918 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  21.84 
 
 		 877 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.52 
 
 		 860 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  21.84 
 
 		 877 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0163  aminopeptidase N  22.15 
 
 		 545 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0529706  normal  0.713182 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  21.52 
 
 		 846 aa  47.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  20.6 
 
 		 890 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  21.84 
 
 		 877 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  21.84 
 
 		 877 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.12 
 
 		 492 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.96 
 
 		 784 aa  46.6  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.16 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.95 
 
 		 499 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  25 
 
 		 848 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  22.87 
 
 		 922 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.27 
 
 		 687 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.55 
 
 		 857 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>