101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1880 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  50 
 
 
792 aa  745    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  45.69 
 
 
815 aa  658    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  45.82 
 
 
816 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  46.24 
 
 
811 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  50.33 
 
 
745 aa  754    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  44.84 
 
 
818 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  46.09 
 
 
821 aa  680    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  53.87 
 
 
793 aa  835    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  70.07 
 
 
778 aa  1156    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  100 
 
 
775 aa  1623    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  53.51 
 
 
792 aa  823    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  53.85 
 
 
801 aa  832    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  48.02 
 
 
770 aa  691    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  41.44 
 
 
838 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  40.43 
 
 
638 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  39.63 
 
 
689 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  37.5 
 
 
666 aa  351  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  35.08 
 
 
756 aa  338  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  35.89 
 
 
900 aa  337  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  35.82 
 
 
668 aa  316  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  35.68 
 
 
732 aa  301  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  34.47 
 
 
655 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  34.65 
 
 
655 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  33.96 
 
 
655 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  34.29 
 
 
655 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  32.21 
 
 
663 aa  258  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  30.51 
 
 
631 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  26.65 
 
 
610 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  31.02 
 
 
526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  26.63 
 
 
603 aa  171  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  26.28 
 
 
1079 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  25.81 
 
 
623 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.42 
 
 
619 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.42 
 
 
640 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  23.99 
 
 
1026 aa  164  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.53 
 
 
620 aa  164  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  25.14 
 
 
628 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.55 
 
 
649 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.43 
 
 
480 aa  110  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.26 
 
 
506 aa  87.8  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.31 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.18 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.37 
 
 
504 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  20.8 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.21 
 
 
673 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.79 
 
 
834 aa  57.4  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
863 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.86 
 
 
492 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.16 
 
 
821 aa  55.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.81 
 
 
824 aa  55.1  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.52 
 
 
822 aa  54.7  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.79 
 
 
846 aa  53.9  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  21.49 
 
 
887 aa  52.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  21.57 
 
 
877 aa  52.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  20.69 
 
 
875 aa  52  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.28 
 
 
878 aa  51.6  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.29 
 
 
768 aa  52  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.29 
 
 
860 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  24.07 
 
 
870 aa  51.2  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.79 
 
 
823 aa  50.8  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  19.92 
 
 
829 aa  50.8  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.06 
 
 
857 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.18 
 
 
485 aa  51.2  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.06 
 
 
857 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  23.26 
 
 
877 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  21.88 
 
 
877 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  21.88 
 
 
877 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.89 
 
 
538 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.73 
 
 
559 aa  49.3  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  22.33 
 
 
877 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  27.92 
 
 
688 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  22.33 
 
 
877 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  22.33 
 
 
877 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  22.33 
 
 
918 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.27 
 
 
835 aa  48.5  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  27.95 
 
 
889 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  22.57 
 
 
881 aa  47.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.13 
 
 
905 aa  47.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  28.75 
 
 
861 aa  47.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  23.42 
 
 
883 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  21.88 
 
 
877 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.15 
 
 
517 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  24.49 
 
 
509 aa  47  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.33 
 
 
858 aa  46.6  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.32 
 
 
471 aa  45.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.52 
 
 
503 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.46 
 
 
866 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  27.33 
 
 
869 aa  45.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.83 
 
 
470 aa  45.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  27.22 
 
 
867 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  27.22 
 
 
867 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  27.22 
 
 
867 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  19.21 
 
 
889 aa  44.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.92 
 
 
492 aa  45.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.14 
 
 
702 aa  44.3  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  28.66 
 
 
874 aa  44.3  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.17 
 
 
488 aa  44.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.185093  hitchhiker  0.00804197 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  23.72 
 
 
827 aa  43.9  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  18.32 
 
 
442 aa  44.3  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.32 
 
 
686 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>