212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1830 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  100 
 
 
663 aa  1345    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  36.84 
 
 
638 aa  355  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  35.86 
 
 
900 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  34.81 
 
 
689 aa  333  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  34.62 
 
 
666 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  35.66 
 
 
732 aa  313  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  34.48 
 
 
668 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  32.35 
 
 
756 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  31.23 
 
 
631 aa  290  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  32.4 
 
 
655 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  32.4 
 
 
655 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  32.26 
 
 
655 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  31.96 
 
 
655 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  29.04 
 
 
610 aa  267  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  33.06 
 
 
838 aa  266  8e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  32.38 
 
 
775 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  31.96 
 
 
792 aa  254  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  31.9 
 
 
801 aa  253  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  31.36 
 
 
793 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  28.44 
 
 
623 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  29.45 
 
 
778 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  28.71 
 
 
816 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  31.2 
 
 
811 aa  248  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  31.32 
 
 
792 aa  247  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  30.38 
 
 
745 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  29.68 
 
 
770 aa  243  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  30.76 
 
 
818 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  28.66 
 
 
821 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  28.8 
 
 
815 aa  231  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.71 
 
 
619 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  31.03 
 
 
1026 aa  217  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  26.3 
 
 
603 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  26.24 
 
 
628 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  25.77 
 
 
1079 aa  187  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.62 
 
 
620 aa  177  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.49 
 
 
640 aa  177  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  26.63 
 
 
526 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.98 
 
 
480 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.24 
 
 
834 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.83 
 
 
845 aa  88.2  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.58 
 
 
482 aa  87  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  21.02 
 
 
489 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.2 
 
 
863 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.25 
 
 
649 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.56 
 
 
504 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  22.26 
 
 
922 aa  78.2  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.03 
 
 
865 aa  77.8  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.18 
 
 
822 aa  77.8  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.54 
 
 
559 aa  75.5  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  23.38 
 
 
829 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.49 
 
 
768 aa  73.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.24 
 
 
673 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.55 
 
 
506 aa  72  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.54 
 
 
857 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.54 
 
 
857 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.01 
 
 
860 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.68 
 
 
823 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.74 
 
 
858 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.49 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.48 
 
 
866 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.16 
 
 
824 aa  67.8  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.05 
 
 
865 aa  67.8  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.79 
 
 
821 aa  67.8  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.57 
 
 
823 aa  67.4  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.75 
 
 
905 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.28 
 
 
686 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.59 
 
 
846 aa  67  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.65 
 
 
551 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.92 
 
 
822 aa  65.1  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  23.56 
 
 
827 aa  64.3  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27 
 
 
852 aa  64.3  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  25.73 
 
 
688 aa  62.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  22.01 
 
 
877 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  22.01 
 
 
918 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  22.01 
 
 
877 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  23.76 
 
 
870 aa  60.8  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  22.01 
 
 
877 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  23.4 
 
 
858 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.84 
 
 
504 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.39 
 
 
527 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  22.61 
 
 
877 aa  57.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1561  M1 family peptidase  28.48 
 
 
598 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  21.66 
 
 
877 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  21.66 
 
 
877 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.61 
 
 
835 aa  56.6  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  27.37 
 
 
690 aa  56.6  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3448  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.38 
 
 
595 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.98 
 
 
597 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.68 
 
 
702 aa  55.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1997  M1 family peptidase  29.93 
 
 
628 aa  55.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1383  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.15 
 
 
623 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.03 
 
 
688 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1367  leukotriene A4 hydrolase  27.15 
 
 
623 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.66 
 
 
518 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  21.34 
 
 
877 aa  54.7  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2977  Leukotriene A4 hydrolase  27.15 
 
 
623 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  normal  0.0102393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2706  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.15 
 
 
605 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000383424  hitchhiker  0.0000144505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2876  response regulator receiver protein  27.81 
 
 
604 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000228252  hitchhiker  0.000169705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1406  leukotriene A4 hydrolase  27.15 
 
 
623 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  24.73 
 
 
1103 aa  54.3  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>