More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2330 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2330  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 741 aa  1496    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0874  ATPase  97.98 
 
 		 741 aa  1469    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.889196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0113  ABC transporter related  42.27 
 
 		 919 aa  592  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0940  ABC transporter related  43.28 
 
 		 908 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000214884  normal  0.092594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  42.67 
 
 		 1675 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1128  ABC transporter, transmembrane region  40.68 
 
 		 953 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0416332  normal  0.0760637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3041  ABC transporter related  41.67 
 
 		 950 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  39.56 
 
 		 1717 aa  485  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0091  ABC transporter related  39.77 
 
 		 981 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6119  ABC transporter related  42.14 
 
 		 893 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2945  ABC transporter related  36.48 
 
 		 723 aa  426  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.658105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2231  hypothetical protein  35.51 
 
 		 739 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0407  ABC transporter related  38.22 
 
 		 964 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959946  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2501  ATPase  36.25 
 
 		 917 aa  324  4e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608162  normal  0.380324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  34.25 
 
 		 726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  34.81 
 
 		 721 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15691  hypothetical protein  32.43 
 
 		 473 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  32.78 
 
 		 720 aa  257  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 743 aa  253  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  29.37 
 
 		 700 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  31.56 
 
 		 1038 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  31.56 
 
 		 1038 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.87 
 
 		 908 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.38 
 
 		 1042 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.02 
 
 		 1019 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  32.18 
 
 		 906 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  32.18 
 
 		 906 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  29.11 
 
 		 721 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.78 
 
 		 602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.83 
 
 		 865 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.39 
 
 		 1008 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.39 
 
 		 1008 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.7 
 
 		 1024 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.34 
 
 		 908 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.55 
 
 		 1003 aa  230  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  28.18 
 
 		 699 aa  230  7e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.94 
 
 		 739 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.74 
 
 		 1000 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31 
 
 		 1018 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.04 
 
 		 971 aa  227  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  30.4 
 
 		 726 aa  227  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.36 
 
 		 1001 aa  227  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  29.96 
 
 		 737 aa  226  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.74 
 
 		 980 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  31.85 
 
 		 753 aa  225  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  29.72 
 
 		 719 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  33.2 
 
 		 578 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.04 
 
 		 976 aa  224  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  29.28 
 
 		 892 aa  224  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  31.93 
 
 		 704 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  30.61 
 
 		 706 aa  223  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.47 
 
 		 1018 aa  223  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.81 
 
 		 738 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  29.62 
 
 		 930 aa  223  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.36 
 
 		 1018 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  31.19 
 
 		 712 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.25 
 
 		 720 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  28.98 
 
 		 767 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  28.52 
 
 		 727 aa  220  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  30.27 
 
 		 663 aa  220  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.01 
 
 		 1013 aa  220  7e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  29.68 
 
 		 1040 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  28.29 
 
 		 598 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  28.82 
 
 		 750 aa  218  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  30 
 
 		 731 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  28.68 
 
 		 743 aa  216  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  29.72 
 
 		 641 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.34 
 
 		 739 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  30.94 
 
 		 719 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  27.19 
 
 		 734 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  28.27 
 
 		 770 aa  216  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  28.42 
 
 		 728 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  27.68 
 
 		 968 aa  215  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  29.77 
 
 		 620 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  30 
 
 		 707 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  27.04 
 
 		 731 aa  214  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  27.83 
 
 		 712 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  29.54 
 
 		 720 aa  213  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.86 
 
 		 707 aa  213  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30 
 
 		 741 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  31.19 
 
 		 719 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  29.93 
 
 		 741 aa  213  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  28.42 
 
 		 728 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  30.6 
 
 		 727 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  27.01 
 
 		 734 aa  213  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.03 
 
 		 705 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  30.7 
 
 		 725 aa  212  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  26.98 
 
 		 739 aa  210  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  27.14 
 
 		 748 aa  210  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  30.27 
 
 		 975 aa  210  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  27.84 
 
 		 725 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  30.07 
 
 		 744 aa  209  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  30.51 
 
 		 688 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  31.17 
 
 		 725 aa  208  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  27.31 
 
 		 721 aa  208  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  27.69 
 
 		 724 aa  208  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  27.69 
 
 		 724 aa  208  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  28.35 
 
 		 727 aa  207  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  24.77 
 
 		 717 aa  206  9e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  28.51 
 
 		 986 aa  206  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>