More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15691 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_15691  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  967    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0113  ABC transporter related  33.96 
 
 
919 aa  289  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3041  ABC transporter related  36.13 
 
 
950 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499618 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2501  ATPase  34.03 
 
 
917 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608162  normal  0.380324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  35.86 
 
 
1675 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1128  ABC transporter, transmembrane region  32.58 
 
 
953 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0416332  normal  0.0760637 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6119  ABC transporter related  34.98 
 
 
893 aa  260  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2330  ABC transporter-related protein  32.43 
 
 
741 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596472  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0940  ABC transporter related  32.29 
 
 
908 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000214884  normal  0.092594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  30.52 
 
 
1717 aa  257  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0874  ATPase  32.64 
 
 
741 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.889196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0091  ABC transporter related  34.58 
 
 
981 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2945  ABC transporter related  31.86 
 
 
723 aa  243  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.658105  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2231  hypothetical protein  30.93 
 
 
739 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0407  ABC transporter related  32.18 
 
 
964 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  29.98 
 
 
726 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  30.15 
 
 
721 aa  210  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.93 
 
 
1018 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.26 
 
 
1019 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  30.45 
 
 
1018 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  29.96 
 
 
1040 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.57 
 
 
1018 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.58 
 
 
705 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  30.69 
 
 
699 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  27.96 
 
 
734 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  29.68 
 
 
720 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  28.76 
 
 
700 aa  194  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  30.51 
 
 
726 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  30.79 
 
 
906 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  30.36 
 
 
719 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  31.13 
 
 
589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  28.57 
 
 
699 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  30.57 
 
 
906 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  29.62 
 
 
712 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  29.85 
 
 
523 aa  191  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.72 
 
 
739 aa  190  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  29.62 
 
 
712 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  27.81 
 
 
704 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.81 
 
 
704 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  29.62 
 
 
712 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  27.81 
 
 
704 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  29.12 
 
 
737 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  27.71 
 
 
726 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  28.54 
 
 
706 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  30.27 
 
 
575 aa  187  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  43.44 
 
 
596 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  28.57 
 
 
721 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.99 
 
 
971 aa  186  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.66 
 
 
1038 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  28.66 
 
 
1038 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.21 
 
 
739 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.19 
 
 
583 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  31.67 
 
 
634 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.61 
 
 
593 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.6 
 
 
623 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.61 
 
 
583 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.6 
 
 
583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  27.55 
 
 
726 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.6 
 
 
593 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.8 
 
 
586 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.56 
 
 
594 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  28.42 
 
 
683 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.07 
 
 
908 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  32.26 
 
 
598 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  29.32 
 
 
568 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  28.09 
 
 
741 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  27.46 
 
 
573 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.85 
 
 
567 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.83 
 
 
571 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  26.34 
 
 
721 aa  183  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  29.55 
 
 
547 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  30.88 
 
 
767 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.72 
 
 
587 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  26.42 
 
 
731 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.41 
 
 
571 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  29.15 
 
 
743 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  27.23 
 
 
930 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  26.72 
 
 
712 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  29.65 
 
 
770 aa  180  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  27.17 
 
 
695 aa  181  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  29.75 
 
 
712 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  29.7 
 
 
721 aa  180  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  25.55 
 
 
725 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  26.17 
 
 
748 aa  180  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.2 
 
 
571 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.2 
 
 
571 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.2 
 
 
571 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.2 
 
 
571 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.2 
 
 
571 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  29.46 
 
 
975 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  40.24 
 
 
589 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.88 
 
 
597 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.72 
 
 
574 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  27.79 
 
 
724 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.72 
 
 
596 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.72 
 
 
574 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.78 
 
 
571 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.72 
 
 
596 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  27.03 
 
 
719 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  27.62 
 
 
581 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>