More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1128 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  48.02 
 
 
1675 aa  815    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1128  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 
953 aa  1930    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0416332  normal  0.0760637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0940  ABC transporter related  39.29 
 
 
908 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000214884  normal  0.092594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3041  ABC transporter related  47.32 
 
 
950 aa  812    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  40.53 
 
 
1717 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0113  ABC transporter related  43.74 
 
 
919 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441754  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0874  ATPase  40.82 
 
 
741 aa  538  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.889196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2330  ABC transporter-related protein  40.68 
 
 
741 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596472  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0091  ABC transporter related  37.71 
 
 
981 aa  512  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0407  ABC transporter related  36.71 
 
 
964 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959946  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2945  ABC transporter related  37.7 
 
 
723 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.658105  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6119  ABC transporter related  40.76 
 
 
893 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2231  hypothetical protein  38.1 
 
 
739 aa  425  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2501  ATPase  39.85 
 
 
917 aa  372  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608162  normal  0.380324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  33.28 
 
 
726 aa  290  9e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  30.07 
 
 
1038 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
1038 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15691  hypothetical protein  32.64 
 
 
473 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  31.58 
 
 
721 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  35.11 
 
 
743 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  33.79 
 
 
720 aa  271  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.65 
 
 
908 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  31.21 
 
 
906 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  31.15 
 
 
906 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.32 
 
 
1019 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.5 
 
 
739 aa  259  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  30.27 
 
 
743 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  31.51 
 
 
731 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.5 
 
 
720 aa  251  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30 
 
 
725 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  30.63 
 
 
721 aa  249  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  28.41 
 
 
726 aa  248  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  30.41 
 
 
727 aa  248  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  27.46 
 
 
1042 aa  247  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.44 
 
 
738 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  31.43 
 
 
739 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  30.55 
 
 
892 aa  244  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  30.51 
 
 
750 aa  244  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  30.33 
 
 
724 aa  244  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  30.33 
 
 
724 aa  244  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.88 
 
 
865 aa  244  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.36 
 
 
728 aa  243  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  29.75 
 
 
930 aa  242  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  30.53 
 
 
908 aa  242  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.6 
 
 
741 aa  241  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  30.54 
 
 
728 aa  240  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  29.25 
 
 
731 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.57 
 
 
999 aa  239  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  30.49 
 
 
753 aa  238  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.04 
 
 
1000 aa  237  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.39 
 
 
1001 aa  237  9e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  28.89 
 
 
706 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  31.08 
 
 
719 aa  236  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.59 
 
 
1013 aa  234  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  28.87 
 
 
712 aa  234  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  28.95 
 
 
968 aa  234  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.26 
 
 
721 aa  234  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  28.7 
 
 
712 aa  233  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  30.28 
 
 
712 aa  233  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.34 
 
 
1008 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.34 
 
 
1008 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  28.87 
 
 
1040 aa  232  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.41 
 
 
720 aa  231  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  29.28 
 
 
720 aa  231  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.73 
 
 
1003 aa  230  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  27.36 
 
 
726 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  30.08 
 
 
719 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.11 
 
 
971 aa  228  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  28.7 
 
 
712 aa  228  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.92 
 
 
717 aa  228  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  30.41 
 
 
720 aa  228  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.84 
 
 
1018 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  30.07 
 
 
739 aa  226  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  28.47 
 
 
699 aa  225  3e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  29.29 
 
 
719 aa  224  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  28.41 
 
 
733 aa  224  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  31.69 
 
 
726 aa  223  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  30.07 
 
 
1018 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.66 
 
 
1018 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  26.92 
 
 
700 aa  222  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.73 
 
 
1024 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  29.62 
 
 
1011 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  29.35 
 
 
975 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.26 
 
 
717 aa  221  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  29.14 
 
 
712 aa  221  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  27.56 
 
 
737 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.89 
 
 
976 aa  219  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  27.29 
 
 
982 aa  219  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  28.01 
 
 
739 aa  218  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.08 
 
 
770 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  27.44 
 
 
753 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.47 
 
 
980 aa  217  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  28.72 
 
 
734 aa  217  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  28.25 
 
 
714 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  27.29 
 
 
721 aa  216  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  31.16 
 
 
744 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  27.44 
 
 
772 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.15 
 
 
603 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  27.44 
 
 
753 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  28.44 
 
 
688 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>