More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0407 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0091  ABC transporter related  77 
 
 		 981 aa  1258    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0407  ABC transporter related  100 
 
 		 964 aa  1858    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3041  ABC transporter related  39.66 
 
 		 950 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0940  ABC transporter related  37.75 
 
 		 908 aa  546  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000214884  normal  0.092594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1128  ABC transporter, transmembrane region  37.54 
 
 		 953 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0416332  normal  0.0760637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0113  ABC transporter related  40.27 
 
 		 919 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  31.49 
 
 		 1717 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0874  ATPase  39.15 
 
 		 741 aa  481  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.889196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  39.84 
 
 		 1675 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2330  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 		 741 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6119  ABC transporter related  44.49 
 
 		 893 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2945  ABC transporter related  37.63 
 
 		 723 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.658105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2231  hypothetical protein  36.69 
 
 		 739 aa  362  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2501  ATPase  34.73 
 
 		 917 aa  342  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608162  normal  0.380324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  33.44 
 
 		 726 aa  290  8e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  34.61 
 
 		 721 aa  281  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  33.33 
 
 		 725 aa  261  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  34 
 
 		 720 aa  261  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 743 aa  258  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  34.08 
 
 		 705 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.92 
 
 		 865 aa  253  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  32.75 
 
 		 906 aa  253  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  32.11 
 
 		 906 aa  251  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  30.12 
 
 		 700 aa  250  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  33.33 
 
 		 728 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  32.77 
 
 		 728 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 		 892 aa  249  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  31.41 
 
 		 743 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.56 
 
 		 976 aa  248  4e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.61 
 
 		 1019 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.45 
 
 		 1003 aa  244  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  33.16 
 
 		 720 aa  242  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  32.32 
 
 		 1038 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.34 
 
 		 971 aa  241  5e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.81 
 
 		 908 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  32.32 
 
 		 1038 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15691  hypothetical protein  32.69 
 
 		 473 aa  241  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  33.74 
 
 		 731 aa  240  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  34.34 
 
 		 750 aa  239  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.29 
 
 		 1024 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  32.26 
 
 		 719 aa  238  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  24.6 
 
 		 737 aa  237  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  32.75 
 
 		 724 aa  237  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  32.75 
 
 		 724 aa  237  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.86 
 
 		 1000 aa  237  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  32.85 
 
 		 739 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  27.8 
 
 		 726 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  33.63 
 
 		 712 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  33.33 
 
 		 741 aa  235  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  33.51 
 
 		 720 aa  235  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  33.94 
 
 		 721 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  32.49 
 
 		 772 aa  234  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.33 
 
 		 720 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 		 753 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  30.88 
 
 		 975 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.32 
 
 		 753 aa  233  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 753 aa  233  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  31.97 
 
 		 719 aa  233  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  30.17 
 
 		 719 aa  233  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 753 aa  233  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 753 aa  233  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  31.51 
 
 		 731 aa  232  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 753 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 		 720 aa  231  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.72 
 
 		 980 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.99 
 
 		 770 aa  230  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  30.93 
 
 		 712 aa  229  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.02 
 
 		 999 aa  228  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.47 
 
 		 1008 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.63 
 
 		 739 aa  227  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.47 
 
 		 1008 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.93 
 
 		 1001 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  30.59 
 
 		 726 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.96 
 
 		 1013 aa  226  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  27.56 
 
 		 982 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.51 
 
 		 717 aa  224  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  34.09 
 
 		 726 aa  224  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  28.5 
 
 		 930 aa  224  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  32.83 
 
 		 739 aa  223  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  31 
 
 		 712 aa  223  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  30.28 
 
 		 767 aa  222  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.37 
 
 		 1042 aa  222  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  28.47 
 
 		 699 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.38 
 
 		 1018 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  30.53 
 
 		 725 aa  221  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  28.89 
 
 		 721 aa  221  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  30.65 
 
 		 712 aa  221  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  30.93 
 
 		 706 aa  220  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  32.07 
 
 		 1011 aa  218  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  28.21 
 
 		 733 aa  218  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  30.59 
 
 		 1018 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  30.88 
 
 		 744 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  31.06 
 
 		 744 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  33.16 
 
 		 753 aa  215  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  28.72 
 
 		 1040 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  30.47 
 
 		 712 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  29.69 
 
 		 683 aa  213  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  27.73 
 
 		 727 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  33.48 
 
 		 726 aa  213  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  30.56 
 
 		 688 aa  212  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>