More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0155 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0155  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1714  translation initiation factor IF-3  88.56 
 
 		 226 aa  331  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0122  translation initiation factor IF-3  87.56 
 
 		 206 aa  329  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0175  translation initiation factor IF-3  88.46 
 
 		 210 aa  327  8e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.267913  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2502  translation initiation factor IF-3  91.67 
 
 		 209 aa  326  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.892093  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0171  translation initiation factor IF-3  75.79 
 
 		 202 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0802308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0166  translation initiation factor IF-3  75.79 
 
 		 197 aa  298  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  45.18 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  41.18 
 
 		 239 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0560  translation initiation factor IF-3  40.36 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  41.36 
 
 		 202 aa  137  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  41.72 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2218  translation initiation factor IF-3  41.36 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0420504 
 
 
-
 
NC_002950  PG0991  translation initiation factor IF-3  41.32 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  38.69 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  41.32 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  39.63 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  38.27 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  35.86 
 
 		 357 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  38.27 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  40.36 
 
 		 178 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  40.36 
 
 		 178 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  39.63 
 
 		 194 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  42.11 
 
 		 165 aa  131  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  39.63 
 
 		 194 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  34.17 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  37.27 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  39.63 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 		 166 aa  131  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 		 166 aa  131  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  37.87 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 		 166 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  39.38 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  37.27 
 
 		 164 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  39.76 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  40.37 
 
 		 170 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  37.57 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00820  translation initiation factor IF-3  41.29 
 
 		 155 aa  129  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  39.16 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  39.64 
 
 		 329 aa  128  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  37.87 
 
 		 401 aa  128  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1222  translation initiation factor IF-3  39.16 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000572155  hitchhiker  0.00763284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  40.37 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 		 415 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  36.65 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  36.36 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0993  translation initiation factor IF-3  41.94 
 
 		 156 aa  126  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  37.87 
 
 		 351 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  33.95 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  39.88 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  35.8 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  40.83 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  37.65 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  38.27 
 
 		 197 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  39.16 
 
 		 225 aa  124  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  37.65 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  38.04 
 
 		 179 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  36.75 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  38.41 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  36.75 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  37.28 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  36.9 
 
 		 172 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  36.69 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0025  initiation factor 3  44.96 
 
 		 129 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  34.57 
 
 		 204 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  38.18 
 
 		 180 aa  121  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2619  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 		 176 aa  121  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  36.36 
 
 		 186 aa  121  9e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  35.71 
 
 		 173 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  36.42 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  32.72 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  37.72 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  38.41 
 
 		 396 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  36.2 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  36.84 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  39.24 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  35.8 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  37.2 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  37.2 
 
 		 170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  37.65 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  34.52 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  33.33 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  38.41 
 
 		 356 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  36.81 
 
 		 173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  38.27 
 
 		 173 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  35.58 
 
 		 173 aa  118  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  32.1 
 
 		 171 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>